RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570139.1

CNOT1-222, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 1, human

TSL 2

Gene CNOT1, Length 458 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT1-222	ENST00000570139	MPP3	Q13368	585 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF699	Q32M78	642 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	ARMC3	Q5W041	872 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	KRT74	Q7RTS7	529 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	KIAA1328	Q86T90	577 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM228A	Q86W67	206 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	GPR135	Q8IZ08	494 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	CARF	Q8N187	725 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	BEST2	Q8NFU1	509 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	CPB2	Q96IY4	423 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF560	Q96MR9	790 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	GRIN2D	O15399	1336 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	LACTBL1	A8MY62	500 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	PEX12	O00623	359 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	CDC14B	O60729	498 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	TULP3	O75386	442 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	TSPAN9	O75954	239 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	VNN1	O95497	513 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	CCL5	P13501	91 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	CD19	P15391	556 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	CR2	P20023	1033 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	MLH1	P40692	756 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	GPD2	P43304	727 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	NDUFV1	P49821	464 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	RBP5	P82980	135 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	CUL2	Q13617	745 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	TUBB2A	Q13885	445 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	ACOX1	Q15067	660 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	CSRP2	Q16527	193 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	XKR4	Q5GH76	650 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	SEMA4D	Q92854	862 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	APBB2	Q92870	758 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	TOX2	Q96NM4	488 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	CHP1	Q99653	195 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	MECR	Q9BV79	373 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	GPR88	Q9GZN0	384 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	PTPRJ	Q12913	1337 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	MROH6	A6NGR9	719 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	CBFA2T3	O75081	653 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF623	O75123	536 aa		7.28	□□□□□ -1.24

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