RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 PSKH1P11801 424 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PRLRP16471 622 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CYP24A1Q07973 514 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PDGFRLQ15198 375 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ATAD3CQ5T2N8 411 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FBXO42Q6P3S6 717 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 KAZALD1Q96I82 304 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CPB2Q96IY4 423 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PNMA5Q96PV4 448 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF416Q9BWM5 594 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D13Q9NVG8 400 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ZSCAN32Q9NX65 697 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CMTM6Q9NX76 183 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ACSL5Q9ULC5 683 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ERVW-1Q9UQF0 538 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MT-ND3P03897 115 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 HDCP19113 662 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 HTR7P34969 479 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NOS2P35228 1153 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CASP4P49662 377 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ENPEPQ07075 957 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PKP1Q13835 747 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 KRT31Q15323 416 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SLC39A12Q504Y0 691 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 EOGTQ5NDL2 527 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TAF8Q7Z7C8 310 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SLC35F3Q8IY50 421 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC34Q8IZ02 419 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 HSFY1Q96LI6 401 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PPP3R2Q96LZ3 170 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PHB2Q99623 299 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SLC39A10Q9ULF5 831 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CRYL1Q9Y2S2 319 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ALG5Q9Y673 324 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CLDN25C9JDP6 229 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 RAB3AP20336 220 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MAOBP27338 520 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SERPINA4P29622 427 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SCNN1GP51170 649 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 OCRLQ01968 901 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FOLH1Q04609 750 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GAD2Q05329 585 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF786Q8N393 782 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 OR6Y1Q8NGX8 325 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF398Q8TD17 642 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 USP7Q93009 1102 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FATE1Q969F0 183 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TMBIM4Q9HC24 238 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FAM49BQ9NUQ9 324 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PAK5Q9P286 719 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 DEC1Q9P2X7 70 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CD300AQ9UGN4 299 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GGT7Q9UJ14 662 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GNG8Q9UK08 70 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SNX24Q9Y343 169 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0G2JND7 137 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 A6NCN8 305 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ALX3O95076 343 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 EPB42P16452 691 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PRCPP42785 496 aa6.3□□□□□ -1.4
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PTPRB-210ENST00000551525 RAB43Q86YS6 212 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 AADATQ8N5Z0 425 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 POM121Q96HA1 1249 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 KLHL5Q96PQ7 755 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 OSBPL8Q9BZF1 889 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MAGEE1Q9HCI5 957 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PDGFCQ9NRA1 345 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
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