RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 SPO11Q9Y5K1 396 aa18.96■□□□□ 0.63
PACSIN3-208ENST00000531226 PTPRBP23467 1997 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 ADRA1AP35348 466 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 BLKP51451 505 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 CDK3Q00526 305 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 SNX1Q13596 522 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 ALG11Q2TAA5 492 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 RASGEF1CQ8N431 466 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 EID2Q8N6I1 236 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 OR56A4Q8NGH8 313 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 PBKQ96KB5 322 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 TBATAQ96M53 351 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 WDR24Q96S15 920 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 TRABDQ9H4I3 376 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 HACD3Q9P035 362 aa18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM202A6NGA9 273 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 RASGRP1O95267 797 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 METTL18O95568 372 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 AGTP01019 485 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC4A1P02730 911 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 HK3P52790 923 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 DCDC1P59894 354 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 SRP54P61011 504 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 FAXCQ5TGI0 409 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 RANBP10Q6VN20 620 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 PDXPQ96GD0 296 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 AGAP2Q99490 1192 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRC61Q9BV99 259 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC13A1Q9BZW2 595 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM83DQ9H4H8 585 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 FGF22Q9HCT0 170 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 RAD18Q9NS91 495 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 SPASTQ9UBP0 616 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 FTSJ1Q9UET6 329 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 DGKBQ9Y6T7 804 aa18.94■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 NEMP2A6NFY4 417 aa18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 TNFRSF10CO14798 259 aa18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 AURKAO14965 403 aa18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 SCAMP1O15126 338 aa18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 AQP9O43315 295 aa18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 IFNB1P01574 187 aa18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 GIMD1P0DJR0 217 aa18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 HMGCLP35914 325 aa18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 OLIG2Q13516 323 aa18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 KCTD11Q693B1 232 aa18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 NYAP1Q6ZVC0 841 aa18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 HID1Q8IV36 788 aa18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 TTC30BQ8N4P2 665 aa18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 OR4C6Q8NH72 309 aa18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRC45Q96CN5 670 aa18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 OSBPL9Q96SU4 736 aa18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 TBL1YQ9BQ87 522 aa18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 APOL2Q9BQE5 337 aa18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 CDH19Q9H159 772 aa18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 NLGN3Q9NZ94 848 aa18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP18.93■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 FFAR2O15552 330 aa18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 TNFSF14O43557 240 aa18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 TNFP01375 233 aa18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 ACTN2P35609 894 aa18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 PRRT3Q5FWE3 981 aa18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 KCTD16Q68DU8 428 aa18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 RD3Q7Z3Z2 195 aa18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 GPR26Q8NDV2 337 aa18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 LMX1AQ8TE12 382 aa18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 OR1E3Q8WZA6 343 aa18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 HOMER3Q9NSC5 361 aa18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 SNX12Q9UMY4 172 aa18.92■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 PRSS38A1L453 326 aa18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 FADS2P1A8MWK0 482 aa18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIM38O00635 465 aa18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 PSMD3O43242 534 aa18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 USP12O75317 370 aa18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 ADRB1P08588 477 aa18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 ALPPL2P10696 532 aa18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 BPIP17213 487 aa18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 FDFT1P37268 417 aa18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 SPARCL1Q14515 664 aa18.91■□□□□ 0.62
PACSIN3-208ENST00000531226 HS1BP3Q53T59 392 aa18.91■□□□□ 0.62
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