RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 FZD6O60353 706 aa16.86■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 SOD1P00441 154 aa16.86■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 SERPING1P05155 500 aa16.86■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 CYP1A2P05177 515 aa16.86■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 IVLP07476 585 aa16.86■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 FAM228BP0C875 321 aa16.86■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 BIRC2Q13490 618 aa16.86■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 NR1D2Q14995 579 aa16.86■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 LRRC49Q8IUZ0 686 aa16.86■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 NDUFAF2Q8N183 169 aa16.86■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 FAM71BQ8TC56 605 aa16.86■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 CPLX3Q8WVH0 158 aa16.86■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 SCAMP4Q969E2 229 aa16.86■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 AP2M1Q96CW1 435 aa16.86■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 SGF29Q96ES7 293 aa16.86■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 NUDT22Q9BRQ3 303 aa16.86■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 FUCA2Q9BTY2 467 aa16.86■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 SEPT10Q9P0V9 454 aa16.86■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 CFAP46Q8IYW2 2715 aa16.86■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 A0A0J9YYE9 177 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 C9orf172C9J069 976 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 MYO1FO00160 1098 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 PPM1DO15297 605 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 MAP3K6O95382 1288 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 TRBC1P01850 177 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 CCL4P13236 92 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 CD1CP29017 333 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 PBX1P40424 430 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 GARSP41250 739 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 ACTR1BP42025 376 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 ARSEP51690 589 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 ACTR1AP61163 376 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 FANCCQ00597 558 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 DSC2Q02487 901 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 PTSQ03393 145 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 GALNT2Q10471 571 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 IHHQ14623 411 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 NFKBIBQ15653 356 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 MANEAQ5SRI9 462 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 CCDC122Q5T0U0 273 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 TRIM74Q86UV6 250 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 VASH2Q86V25 355 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 RCBTB1Q8NDN9 531 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 AGAP2Q99490 1192 aa16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 ZW10O43264 779 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 GJC1P36383 396 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 GPR3P46089 330 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 EPHB1P54762 984 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 ZBED6P86452 979 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 PEX6Q13608 980 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 DPYSL3Q14195 570 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 HADHQ16836 314 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 TMEM164Q5U3C3 297 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 NKAIN2Q5VXU1 208 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 LUZP1Q86V48 1076 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 DTX1Q86Y01 620 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 CPNE8Q86YQ8 564 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 EXD3Q8N9H8 876 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 MAML1Q92585 1016 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 CCDC74BQ96LY2 380 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 OR2M4Q96R27 311 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 CDH19Q9H159 772 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 CBX8Q9HC52 389 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 CAPN11Q9UMQ6 739 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 CHKBQ9Y259 395 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 TTLL3Q9Y4R7 772 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 COL6A6A6NMZ7 2263 aa16.84■□□□□ 0.29
HERC3-211ENST00000513325 MATN3O15232 486 aa16.83■□□□□ 0.28
HERC3-211ENST00000513325 ZNF30P17039 623 aa16.83■□□□□ 0.28
HERC3-211ENST00000513325 CES1P23141 567 aa16.83■□□□□ 0.28
HERC3-211ENST00000513325 UBASH3AP57075 661 aa16.83■□□□□ 0.28
HERC3-211ENST00000513325 LINC00303Q3SY05 128 aa16.83■□□□□ 0.28
HERC3-211ENST00000513325 PYCR3Q53H96 274 aa16.83■□□□□ 0.28
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa16.83■□□□□ 0.28
HERC3-211ENST00000513325 ALG1LQ6GMV1 187 aa16.83■□□□□ 0.28
HERC3-211ENST00000513325 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
HERC3-211ENST00000513325 ZNF765Q7L2R6 523 aa16.83■□□□□ 0.28
HERC3-211ENST00000513325 NLRP8Q86W28 1048 aa16.83■□□□□ 0.28
HERC3-211ENST00000513325 KCTD6Q8NC69 237 aa16.83■□□□□ 0.28
HERC3-211ENST00000513325 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
HERC3-211ENST00000513325 LRRN4Q8WUT4 740 aa16.83■□□□□ 0.28
HERC3-211ENST00000513325 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa16.83■□□□□ 0.28
HERC3-211ENST00000513325 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
HERC3-211ENST00000513325 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms