RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505459.5

SRP19-204, Transcript of signal recognition particle 19, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRP19, Length 2,841 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP19-204ENST00000505459 TXNDC8Q6A555 127 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 PDSS2Q86YH6 399 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 MDGA1Q8NFP4 955 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 ASB2Q96Q27 587 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 TCF12Q99081 682 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 WDR41Q9HAD4 459 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 BPIFA1Q9NP55 256 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 STOML2Q9UJZ1 356 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 SARDHQ9UL12 918 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 SPO11Q9Y5K1 396 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 DENND4CQ5VZ89 1909 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 CCDC189A1A4V9 331 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 PEX1O43933 1283 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 SMIM24O75264 130 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 MTHFD2P13995 350 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 ATP4BP51164 291 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 THOP1P52888 689 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 IKBKEQ14164 716 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 OR6K2Q8NGY2 324 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 UCMAQ8WVF2 138 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 ATOH8Q96SQ7 321 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 MUC3BQ9H195 1237 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 MED16Q9Y2X0 877 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 UBDO15205 165 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 MT-CO1P00395 513 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 HDCP19113 662 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 CD9P21926 228 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 ALDH1A3P47895 512 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 CEACAM7Q14002 265 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 OR4D1Q15615 310 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 ADGRF1Q5T601 910 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 AFTPHQ6ULP2 937 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 ZNF783Q6ZMS7 281 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 TMEM150AQ86TG1 271 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 SNX31Q8N9S9 440 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 LPGAT1Q92604 370 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 TMEM169Q96HH4 297 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 KLHL4Q9C0H6 718 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 DERL2Q9GZP9 239 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 VCX3BQ9H321 246 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 TMEM39AQ9NV64 488 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 OGDHLQ9ULD0 1010 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 YIPF1Q9Y548 306 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 A0A1B0GVM2 712 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 DPPA5A6NC42 116 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 H3BMM5 538 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 K7ERQ8 282 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 CD160O95971 181 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 RHOCP08134 193 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 CSF2RAP15509 400 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 RAG1P15918 1043 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 SH3BP2P78314 561 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 ART3Q13508 389 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 LRP8Q14114 963 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 TMEM126BQ8IUX1 230 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 CLYBLQ8N0X4 340 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 CARNMT1Q8N4J0 409 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 EFHBQ8N7U6 833 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 WFDC5Q8TCV5 224 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 KIAA1191Q96A73 305 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 SCUBE2Q9NQ36 999 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 PSMD13Q9UNM6 376 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 FAM50BQ9Y247 325 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 MAGEA13PA6NCF6 341 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 FBP2O00757 339 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 ACOT8O14734 319 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 SUPT7LO94864 414 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 C1RP00736 705 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 ME2P23368 584 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 PMLP29590 882 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 RPL26P61254 145 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 MS4A2Q01362 244 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP19-204ENST00000505459 STX5Q13190 355 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms