RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504440.1

NPHP3-AS1-202, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,507 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZBTB26Q9HCK0 441 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GTSE1Q9NYZ3 720 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HSFX1Q9UBD0 423 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IPPQ9Y573 584 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 THSD7BQ9C0I4 1608 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KLHL33A6NCF5 533 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PLOD2O00469 737 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FBP2O00757 339 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PMPCBO75439 489 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CABYRO75952 493 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CD4P01730 458 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM200BP0CF97 657 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC1A2P43004 574 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NPY2RP49146 381 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NME5P56597 212 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 YBX1P67809 324 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCNA1P78396 465 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 XIAPP98170 497 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GALNT2Q10471 571 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PRKAA1Q13131 559 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC12A1Q13621 1099 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CSHL1Q14406 222 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SNX17Q15036 470 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CYTH1Q15438 398 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DEFB115Q30KQ5 88 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MGAT5BQ3V5L5 792 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BHLHA9Q7RTU4 235 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HID1Q8IV36 788 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PGAM4Q8N0Y7 254 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR9I1Q8NGQ6 314 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DPF3Q92784 378 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LPPQ93052 612 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PHF21BQ96EK2 531 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ELMO2Q96JJ3 720 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC29A1Q99808 456 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FICDQ9BVA6 458 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IL22Q9GZX6 179 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BRD8Q9H0E9 1235 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RHOJQ9H4E5 214 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 POMKQ9H5K3 350 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 COQ10BQ9H8M1 238 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MIOSQ9NXC5 875 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCDC167Q9P0B6 97 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ACOT9Q9Y305 439 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RNF11Q9Y3C5 154 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 COL1A2P08123 1366 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C9JVG2 144 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ATP6AP2O75787 350 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EPHX1P07099 455 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 WARSP23381 471 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KCNC1P48547 511 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PSME3P61289 254 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CDH17Q12864 832 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CLEC6AQ6EIG7 209 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TAC4Q86UU9 113 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLCO4A1Q96BD0 722 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HDAC11Q96DB2 347 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CAPNS2Q96L46 248 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SENP8Q96LD8 212 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF560Q96MR9 790 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SERPINI1Q99574 410 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OLFM1Q99784 485 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KIFC1Q9BW19 673 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EFCAB1Q9HAE3 211 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRPC7Q9HCX4 862 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GIMAP2Q9UG22 337 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MAGEB16A2A368 324 aa6.59□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PRORSD1PA6NEY8 169 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.3 ms