RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502366.5

ALPK1-204, Transcript of alpha kinase 1, human

TSL 3

Gene ALPK1, Length 716 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ALPK1-204	ENST00000502366	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	ZNF623	O75123	536 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	SEC14L2	O76054	403 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	METTL18	O95568	372 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	HSPA4L	O95757	839 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	CYP3A7	P24462	503 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	CHML	P26374	656 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	SFN	P31947	248 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	GRK5	P34947	590 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	OR1G1	P47890	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	GLUD2	P49448	558 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	CLCN4	P51793	760 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	JAK3	P52333	1124 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	SNX16	P57768	344 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	NHLH2	Q02577	135 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	OCA2	Q04671	838 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	TUBB3	Q13509	450 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	FAM187B	Q17R55	369 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	MTSS1L	Q765P7	747 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	PALB2	Q86YC2	1186 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	DCLK2	Q8N568	766 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	SNX19	Q92543	992 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	RNFT2	Q96EX2	444 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	PERP	Q96FX8	193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	VMP1	Q96GC9	406 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	C5orf34	Q96MH7	638 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	MRGBP	Q9NV56	204 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	BARHL2	Q9NY43	387 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	MPP6	Q9NZW5	540 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	EVPL	Q92817	2033 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	FAM86B1	E9PN63	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	TEX28	O15482	410 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	ASAP2	O43150	1006 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	TADA2A	O75478	443 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	ERLIN2	O94905	339 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	GPANK1	O95872	356 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	IGHD	P01880	384 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	SPARC	P09486	303 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	COX7A2	P14406	83 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	NFKBIA	P25963	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	MAGEA9	P43362	315 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	SLC11A1	P49279	550 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	MVD	P53602	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	UFM1	P61960	85 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	HSD11B2	P80365	405 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	CBFB	Q13951	182 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	GRM7	Q14831	915 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	USP41	Q3LFD5	358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	XKR3	Q5GH77	459 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	LIN9	Q5TKA1	542 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ALPK1-204	ENST00000502366	HTR3D	Q70Z44	454 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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