RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499624.3

GABPB1-AS1-202, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1-AS1, Length 16,182 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DEPDC7Q96QD5 511 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TBCDQ9BTW9 1192 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ELOVL6Q9H5J4 265 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RIMKLBQ9ULI2 386 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRIM13O60858 407 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SNX4O95219 450 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PIGRP01833 764 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GPR143P51810 404 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BMPR2Q13873 1038 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 QRICH1Q2TAL8 776 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RGMBQ6NW40 437 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF549Q6P9A3 640 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CARNMT1Q8N4J0 409 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 STYXQ8WUJ0 223 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C12orf66Q96MD2 445 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 AGPAT1Q99943 283 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ECSITQ9BQ95 431 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FKBP14Q9NWM8 211 aa4.53□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LSM1O15116 133 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CDH4P55283 916 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PER3P56645 1201 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ERVK-21P61565 698 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PARP6Q2NL67 630 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC25A25Q6KCM7 469 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FIGLAQ6QHK4 219 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CHST3Q7LGC8 479 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FITM2Q8N6M3 262 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CKAP2Q8WWK9 683 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CLPTM1LQ96KA5 538 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LRRC2Q9BYS8 371 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZYG11BQ9C0D3 744 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NELFAQ9H3P2 528 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SERPINA1P01009 418 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PTPN7P35236 360 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HTR3AP46098 478 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SMCO1Q147U7 214 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ELOCQ15369 112 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KLHL7Q8IXQ5 586 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TXNDC12O95881 172 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GPC1P35052 558 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DOC2AQ14183 400 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM214AQ32MH5 1076 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NTAN1Q96AB6 310 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ATXN3LQ9H3M9 355 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TAB2Q9NYJ8 693 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM25AB3EWG3 89 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM25CB3EWG5 89 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM25GB3EWG6 89 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MAGEA11P43364 429 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TSFMP43897 325 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NUDT6P53370 316 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MGAT5BQ3V5L5 792 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 XKR5Q6UX68 686 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZER1Q7Z7L7 766 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RASSF3Q86WH2 238 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 XYLT1Q86Y38 959 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PLD3Q8IV08 490 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC6A16Q9GZN6 736 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OPTCQ9UBM4 332 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SPEF1Q9Y4P9 236 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MCM3APO60318 1980 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TNFAIP8O95379 198 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP4.52□□□□□ -1.692e-8■□□□□ 9
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NR2F6P10588 404 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CCNG1P51959 295 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ACAD10Q6JQN1 1059 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ANKFN1Q8N957 763 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HIPK4Q8NE63 616 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KCNJ9Q92806 393 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EFCAB11Q9BUY7 163 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PORCNQ9H237 461 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IFT46Q9NQC8 304 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NDFIP2Q9NV92 336 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ACOT9Q9Y305 439 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SUPT7LO94864 414 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MC3RP41968 323 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CYP27C1Q4G0S4 372 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SEMA4CQ9C0C4 833 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FANCLQ9NW38 375 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MIOSQ9NXC5 875 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 URB1O60287 2271 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UGDHO60701 494 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LTFP02788 710 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HIST1H2ABP04908 130 aa4.52□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms