RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	FAM171B	Q6P995	826 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	VSTM1	Q6UX27	236 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	SRL	Q86TD4	932 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	YAF2	Q8IY57	180 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	FITM2	Q8N6M3	262 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	FGF13	Q92913	245 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	PSMG2	Q969U7	264 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	MYLPF	Q96A32	169 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	FAM81B	Q96LP2	452 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	CDH22	Q9UJ99	828 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	CDYL	Q9Y232	598 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	4.69	□□□□□ -1.66	1e-10	■□□□□ 9.1
RBM39-240	ENST00000495293	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	ATP2C2	O75185	946 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	ERLIN1	O75477	346 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	SOAT2	O75908	522 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	HAUS5	O94927	633 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	ZBED1	O96006	694 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	TUBB	P07437	444 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	CCDC175	P0C221	793 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	BDNF	P23560	247 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	FMO5	P49326	533 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	VAV2	P52735	878 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	NDST1	P52848	882 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	GNG11	P61952	73 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	CCZ1B	P86790	482 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	DSC2	Q02487	901 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	TLE1	Q04724	770 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	DMTN	Q08495	405 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	TRIM14	Q14142	442 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	TEAD2	Q15562	447 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	TTI2	Q6NXR4	508 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	ACOT1	Q86TX2	421 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	CNGA4	Q8IV77	575 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	VSTM4	Q8IW00	320 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	NUP93	Q8N1F7	819 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	MIER2	Q8N344	545 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	STKLD1	Q8NE28	680 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	TMIE	Q8NEW7	156 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	ITFG1	Q8TB96	612 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	ING5	Q8WYH8	240 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	SLC9A6	Q92581	669 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	GOLGA1	Q92805	767 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	SMARCD2	Q92925	531 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	SLC35C1	Q96A29	364 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	PCED1B	Q96HM7	432 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	SPATA17	Q96L03	361 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	MYADM	Q96S97	322 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RBM39-240	ENST00000495293	NACA2	Q9H009	215 aa		4.68	□□□□□ -1.66

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