RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492895.1

ANKRD28-211, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-211ENST00000492895 PIGOQ8TEQ8 1089 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 SUSD6Q92537 303 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 WASF1Q92558 559 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 IGSF21Q96ID5 467 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM20AQ96MK3 541 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 KLHL5Q96PQ7 755 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM118BQ9BPY3 351 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 AGXT2Q9BYV1 514 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM8AQ9HCN3 771 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 RXFP3Q9NSD7 469 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 CACNG4Q9UBN1 327 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 TAGLN3Q9UI15 199 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 COMMD10Q9Y6G5 202 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ASPMQ8IZT6 3477 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 FSD2A1L4K1 749 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ARL5CA6NH57 179 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 CASTOR2A6NHX0 329 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 E5RJQ4 531 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 PPEF2O14830 753 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 TEX28O15482 410 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 TSPAN1O60635 241 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 PFKFB2O60825 505 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 PEX14O75381 377 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 RFPL2O75678 378 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 RNF8O76064 485 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 LARGE1O95461 756 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 CTDNEP1O95476 244 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 GLUD1P00367 558 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 NPPBP16860 134 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 MTHFRP42898 656 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 EVCP57679 992 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 PPP2R5CQ13362 524 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 KCNC3Q14003 757 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 TFDP1Q14186 410 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 SPARCL1Q14515 664 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 MFSD13AQ14CX5 517 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ANKRD1Q15327 319 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ME3Q16798 604 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 SPECC1Q5M775 1068 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 PXDC1Q5TGL8 231 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM90A2PQ658T7 463 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 NOTUMQ6P988 496 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 MOXD1Q6UVY6 613 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 C4orf19Q8IY42 314 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 EXOC8Q8IYI6 725 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 FBXL16Q8N461 479 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 VPS37AQ8NEZ2 397 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC22A17Q8WUG5 538 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 WDR60Q8WVS4 1066 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 TCP11Q8WWU5 503 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 PMM1Q92871 262 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 MBOAT7Q96N66 472 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 NECTIN4Q96NY8 510 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 CRB3Q9BUF7 120 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 KIFC3Q9BVG8 833 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ADGRE3Q9BY15 652 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 TM6SF1Q9BZW5 370 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ZBP1Q9H171 429 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 VPS16Q9H269 839 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 EPS8L2Q9H6S3 715 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 SAP30LQ9HAJ7 183 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 KCNMB3Q9NPA1 279 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 VPS45Q9NRW7 570 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 MIOSQ9NXC5 875 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 IGSF9Q9P2J2 1179 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 FZD4Q9ULV1 537 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 MAFFQ9ULX9 164 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 PCDHA12Q9UN75 941 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 GDAQ9Y2T3 454 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 ABCA12Q86UK0 2595 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 SMCHD1A6NHR9 2005 aa3.43□□□□□ -1.86
ANKRD28-211ENST00000492895 SPTA1P02549 2419 aa3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms