RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 TBATAQ96M53 351 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 LYSMD1Q96S90 227 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 TEX101Q9BY14 249 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 TMEM168Q9H0V1 697 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 KCTD5Q9NXV2 234 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 SIRPGQ9P1W8 387 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 DNPEPQ9ULA0 475 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 DOLKQ9UPQ8 538 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 SHOC2Q9UQ13 582 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 DGKBQ9Y6T7 804 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 BPTFQ12830 3046 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 APC2O95996 2303 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 PRSS38A1L453 326 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 TNFRSF10CO14798 259 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 ARHGAP6O43182 974 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 MTSS1O43312 755 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 NDST3O95803 873 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 FUCA1P04066 466 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 CEACAM5P06731 702 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 PROS1P07225 676 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 JUPP14923 745 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 CETN2P41208 172 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 WNT3AP56704 352 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 DPTQ07507 201 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 XRCC4Q13426 336 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 NR0B2Q15466 257 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 ST3GAL2Q16842 350 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 KDELC1Q6UW63 502 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 ZNF765Q7L2R6 523 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 NRSN1Q8IZ57 195 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 KYQ8NBH2 561 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 CCL4L1Q8NHW4 92 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 IFI44Q8TCB0 444 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 EID2BQ96D98 161 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 WDR24Q96S15 920 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 BOCQ9BWV1 1114 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 GULP1Q9UBP9 304 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 FAM153AQ9UHL3 310 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 GUCA1BQ9UMX6 200 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 GPR34Q9UPC5 381 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 EFR3BQ9Y2G0 817 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 PKD1L2Q7Z442 2459 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 CASC3O15234 703 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 INPP4BO15327 924 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 TJP3O95049 919 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 PTMAP06454 111 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 RBP3P10745 1247 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 CDK4P11802 303 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 TEAD1P28347 426 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 GNPDA1P46926 289 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 SPINT3P49223 89 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 SLC14A2Q15849 920 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 CCDC70Q6NSX1 233 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 TAF8Q7Z7C8 310 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 TMPRSS12Q86WS5 348 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 GKN2Q86XP6 184 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 SFTPA2Q8IWL1 248 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 SLC25A41Q8N5S1 370 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 CCDC112Q8NEF3 446 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 IPMKQ8NFU5 416 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 CCHCR1Q8TD31 782 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 HES6Q96HZ4 224 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 MRGPRX2Q96LB1 330 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 FCRL5Q96RD9 977 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 GPR63Q9BZJ6 419 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 USP29Q9HBJ7 922 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 PKD2L2Q9NZM6 624 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 RSPH14Q9UHP6 348 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 SUFUQ9UMX1 484 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 ZNF711Q9Y462 761 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 SPO11Q9Y5K1 396 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 ITPR1Q14643 2758 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 CHD6Q8TD26 2715 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-214ENST00000490425 RP1P56715 2156 aa11.96□□□□□ -0.5
NISCH-214ENST00000490425 ZFHX4Q86UP3 3567 aa11.96□□□□□ -0.5
NISCH-214ENST00000490425 ACACAQ13085 2346 aa11.95□□□□□ -0.5
NISCH-214ENST00000490425 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa11.95□□□□□ -0.5
NISCH-214ENST00000490425 TRABD2BA6NFA1 517 aa11.95□□□□□ -0.5
NISCH-214ENST00000490425 FADS2P1A8MWK0 482 aa11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms