RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490308.1

EPB41-212, Transcript of erythrocyte membrane protein band 4.1, humanhuman

TSL 3

Gene EPB41, Length 354 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41-212ENST00000490308 UBE4BO95155 1302 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 ZNF541Q9H0D2 1346 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 A0A087WZY1 265 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 A0A0B4J203 849 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 A0A1W2PRX2 142 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 PCP4L1A6NKN8 68 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 NOTOA8MTQ0 251 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 GRXCR1A8MXD5 290 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 KPNA7A9QM74 516 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 ADM5C9JUS6 153 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 E9PBE3 544 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 BIN1O00499 593 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 CLDN4O14493 209 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 TRIM24O15164 1050 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 LDLRAD4O15165 306 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 CASC3O15234 703 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 CLIC2O15247 247 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 CA12O43570 354 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 PRAMEF10O60809 474 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 TRIM13O60858 407 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 SCGB2A1O75556 95 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 AKAP3O75969 853 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 AKR7A3O95154 331 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 NXPH3O95157 252 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 GH2P01242 217 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 IGLV1-40P01703 118 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 LMNAP02545 664 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 S100A9P06702 114 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 FURINP09958 794 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 G6PDP11413 515 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 MMP9P14780 707 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 CSF2RAP15509 400 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 CREB1P16220 341 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 ITGB5P18084 799 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 FGFR4P22455 802 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 FBLN1P23142 703 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 PRPH2P23942 346 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 CHRNA3P32297 505 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 RFC4P35249 363 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 THBS2P35442 1172 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 IER3P46695 156 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 CD151P48509 253 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 ASCL1P50553 236 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 NME5P56597 212 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 SSTP61278 116 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 YBX1P67809 324 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 SP2Q02086 613 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 FPGSQ05932 587 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 CHIT1Q13231 466 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 DYRK1AQ13627 763 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 NFYCQ13952 458 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 FGFBP1Q14512 234 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 ZMYND11Q15326 602 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 SGCBQ16585 318 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 SOWAHAQ2M3V2 549 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 KIF19Q2TAC6 998 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 AP5B1Q2VPB7 878 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 HFEQ30201 348 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 TBC1D25Q3MII6 688 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 ZNF667Q5HYK9 610 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 SH2D4BQ5SQS7 431 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 TTC39AQ5SRH9 613 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 ARHGEF16Q5VV41 709 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 ARHGAP17Q68EM7 881 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 ENPP7Q6UWV6 458 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 CFAP77Q6ZQR2 320 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 NEK8Q86SG6 692 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 TLK2Q86UE8 772 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 TMPRSS6Q8IU80 811 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 DDIASQ8IXT1 998 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 CCDC13Q8IYE1 715 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 BBS5Q8N3I7 341 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 AFAP1Q8N556 730 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 RNF169Q8NCN4 708 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 SUPT20HQ8NEM7 779 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 CHST13Q8NET6 341 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 SLC35B2Q8TB61 432 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 SHKBP1Q8TBC3 707 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 MIPOL1Q8TD10 442 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 TMEM171Q8WVE6 324 aa2.75□□□□□ -1.97
EPB41-212ENST00000490308 RLN3Q8WXF3 142 aa2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms