RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484403.5

CCT8-208, Transcript of chaperonin containing TCP1 subunit 8, human

TSL 3

Gene CCT8, Length 808 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCT8-208	ENST00000484403	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403		K7ENM7	598 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	ATP1A3	P13637	1013 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	PTPN2	P17706	415 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	AZU1	P20160	251 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	USP8	P40818	1118 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	BLK	P51451	505 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	LMO4	P61968	165 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	NUCB1	Q02818	461 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	PRKG2	Q13237	762 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	NEDD9	Q14511	834 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	C17orf99	Q6UX52	265 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	CPO	Q8IVL8	374 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	CPXM2	Q8N436	756 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	GPATCH11	Q8N954	259 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	SLC32A1	Q9H598	525 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	FEM1B	Q9UK73	627 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	PADI1	Q9ULC6	663 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	CEP104	O60308	925 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	FAM155B	O75949	473 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	TBX18	O95935	607 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	RRM1	P23921	792 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	CTF1	Q16619	201 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	MTSS1L	Q765P7	747 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	HERVK_113	Q902F9	699 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	SERINC2	Q96SA4	455 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	DVL1	O14640	695 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	GFPT2	O94808	682 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	MYOD1	P15172	320 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	CD58	P19256	250 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	RXRA	P19793	462 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	ADD2	P35612	726 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	TLE2	Q04725	743 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	TRPC3	Q13507	836 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	EFR3A	Q14156	821 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	HTRA1	Q92743	480 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	FSD1	Q9BTV5	496 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	DERA	Q9Y315	318 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCT8-208	ENST00000484403	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCT8-208	ENST00000484403	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCT8-208	ENST00000484403	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCT8-208	ENST00000484403	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCT8-208	ENST00000484403	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCT8-208	ENST00000484403	MTA2	O94776	668 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCT8-208	ENST00000484403	G6PD	P11413	515 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCT8-208	ENST00000484403	PCNA	P12004	261 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCT8-208	ENST00000484403	EDN2	P20800	178 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCT8-208	ENST00000484403	DCT	P40126	519 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCT8-208	ENST00000484403	CLCNKA	P51800	687 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCT8-208	ENST00000484403	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCT8-208	ENST00000484403	SPATA1	Q5VX52	437 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCT8-208	ENST00000484403	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCT8-208	ENST00000484403	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCT8-208	ENST00000484403	TRNP1	Q6NT89	227 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCT8-208	ENST00000484403	RGMB	Q6NW40	437 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCT8-208	ENST00000484403	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CCT8-208	ENST00000484403	OR8H2	Q8N162	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCT8-208	ENST00000484403	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCT8-208	ENST00000484403	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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