RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475060.1

CTPS1-207, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 813 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-207ENST00000475060 HMGCLP35914 325 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 KCNC1P48547 511 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 TTPAP49638 278 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 C1QTNF8P60827 252 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 SLC7A9P82251 487 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 CREB5Q02930 508 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 KLC1Q07866 573 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 FOXM1Q08050 763 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 ITKQ08881 620 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 TRAF2Q12933 501 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 CUL3Q13618 768 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 LRP8Q14114 963 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 VEPH1Q14D04 833 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 CCDC6Q16204 474 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 FXNQ16595 210 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 XKR7Q5GH72 579 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 GPR158Q5T848 1215 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 RTL10Q7L3V2 364 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 SNX32Q86XE0 403 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 GALNT13Q8IUC8 556 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 DSELQ8IZU8 1212 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 STK40Q8N2I9 435 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 OR13C4Q8NGS5 318 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 STAG3L4Q8TBR4 150 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 GPR152Q8TDT2 470 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 ACDQ96AP0 544 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 VOPP1Q96AW1 172 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 ROPN1LQ96C74 230 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 ASB9Q96DX5 294 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 LMLNQ96KR4 655 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 BIRC8Q96P09 236 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 SLC25A23Q9BV35 468 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 ADGRE3Q9BY15 652 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 LRRC3Q9BY71 257 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 HIPK3Q9H422 1215 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 MAGEE1Q9HCI5 957 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 TAS2R13Q9NYV9 303 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 IL17CQ9P0M4 197 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 ABCD2Q9UBJ2 740 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 HCSTQ9UBK5 93 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 PPIL1Q9Y3C6 166 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 KCTD3Q9Y597 815 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 RAI2Q9Y5P3 530 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 E2F8A0AVK6 867 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 DYTNA2CJ06 578 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 CCDC78A2IDD5 438 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 NEMP2A6NFY4 417 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 H3BMM5 538 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 TRIM38O00635 465 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 MAP3K7O43318 606 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 TMCC1O94876 653 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 CDK14O94921 469 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 PKMP14618 531 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 PCSK2P16519 638 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 ME2P23368 584 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 PPM1AP35813 382 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 PTGER3P43115 390 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 CCR10P46092 362 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 APLP1P51693 650 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 RPS24P62847 133 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 MXRA7P84157 204 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 LCP2Q13094 533 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 PEX6Q13608 980 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 DSG2Q14126 1118 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 IKBKEQ14164 716 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 GALNT3Q14435 633 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.372e-7■■■■□ 26
CTPS1-207ENST00000475060 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-207ENST00000475060 CDKN3Q16667 212 aa6.49□□□□□ -1.37
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