RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466141.1

RPUSD3-212, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 996 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-212ENST00000466141 IDUAP35475 653 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 HNF4AP41235 474 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 DPP6P42658 865 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 WASP42768 502 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 PPP3CCP48454 512 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 PGFP49763 221 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 COPB1P53618 953 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 IL1RL1Q01638 556 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 BST2Q10589 180 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 NCF4Q15080 339 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 ADRM1Q16186 407 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 MEA1Q16626 185 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 MYLK3Q32MK0 819 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 CDONQ4KMG0 1287 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 AARDQ4LEZ3 155 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 KRTCAP3Q53RY4 240 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 RAB41Q5JT25 222 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 CYB5D1Q6P9G0 228 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 LCLAT1Q6UWP7 414 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 PIGZQ86VD9 579 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 ANKRD52Q8NB46 1076 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 IFI44Q8TCB0 444 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 CALML6Q8TD86 181 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 VPS39Q96JC1 886 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 NSMCE3Q96MG7 304 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 RUNDC3BQ96NL0 473 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 C9orf16Q9BUW7 83 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM192AQ9GZU8 254 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 FBXO44Q9H4M3 255 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 FANCEQ9HB96 536 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 IL21RQ9HBE5 538 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 NEK6Q9HC98 313 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 WASH6PQ9NQA3 447 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 SEMA3GQ9NS98 782 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 ARMC1Q9NVT9 282 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 TOR4AQ9NXH8 423 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC7A8Q9UHI5 535 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 ADGRE2Q9UHX3 823 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 BAG5Q9UL15 447 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 CYP8B1Q9UNU6 501 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 SCML2Q9UQR0 700 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 SIK3Q9Y2K2 1263 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 USP3Q9Y6I4 520 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF462Q96JM2 2506 aa7.36□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 A0A087WV48 116 aa7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 A0A1B0GVG6 124 aa7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 A0A1B0GWJ7 208 aa7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 SH3D21A4FU49 640 aa7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 M0QYV0 167 aa7.35□□□□□ -1.23
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RPUSD3-212ENST00000466141 LEFTY2O00292 366 aa7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 MATN2O00339 956 aa7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 EPHB6O15197 1021 aa7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 MTSS1O43312 755 aa7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 COCHO43405 550 aa7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 CLN5O75503 358 aa7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
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RPUSD3-212ENST00000466141 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
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RPUSD3-212ENST00000466141 UCHL3P15374 230 aa7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 HDCP19113 662 aa7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 KLK7P49862 253 aa7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 MFAP3P55082 362 aa7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC7A9P82251 487 aa7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 ADIGQ0VDE8 80 aa7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 GRIK2Q13002 908 aa7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 DHCR24Q15392 516 aa7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 STILQ15468 1287 aa7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 EOGTQ5NDL2 527 aa7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 SPATC1Q76KD6 591 aa7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa7.35□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF605Q86T29 641 aa7.35□□□□□ -1.23
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