RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	17.7	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	LGR4	Q9BXB1	951 aa		17.7	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	17.7	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	17.7	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		17.7	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		17.7	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	TMEM202	A6NGA9	273 aa		17.69	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	USP27X	A6NNY8	438 aa		17.69	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	GCAT	O75600	419 aa		17.69	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	RASGRP1	O95267	797 aa		17.69	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	TNF	P01375	233 aa		17.69	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	17.69	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	ALPPL2	P10696	532 aa		17.69	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	HLA-DPA1	P20036	260 aa		17.69	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	17.69	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	ACTN2	P35609	894 aa		17.69	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	TRIM23	P36406	574 aa		17.69	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	KIAA1024L	P59773	190 aa		17.69	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	17.69	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	DPT	Q07507	201 aa		17.69	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	CDKN3	Q16667	212 aa		17.69	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	PARP6	Q2NL67	630 aa		17.69	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	ALG11	Q2TAA5	492 aa		17.69	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	ALS2CL	Q60I27	953 aa		17.69	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		17.69	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	17.69	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		17.69	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	17.69	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		17.69	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	SPAST	Q9UBP0	616 aa		17.69	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	17.69	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		17.69	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	INPP4B	O15327	924 aa		17.68	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	AQP9	O43315	295 aa		17.68	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	17.68	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	FGF1	P05230	155 aa		17.68	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	17.68	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	17.68	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	HK3	P52790	923 aa		17.68	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	CDK3	Q00526	305 aa		17.68	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	OLIG2	Q13516	323 aa		17.68	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	SPARCL1	Q14515	664 aa		17.68	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	17.68	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	CCNG2	Q16589	344 aa		17.68	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	P3H1	Q32P28	736 aa		17.68	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	DOK6	Q6PKX4	331 aa		17.68	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		17.68	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		17.68	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		17.68	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		17.68	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	CCDC89	Q8N998	374 aa		17.68	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	PBK	Q96KB5	322 aa		17.68	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	AGAP2	Q99490	1192 aa		17.68	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		17.68	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	TEX101	Q9BY14	249 aa		17.68	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		17.68	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		17.68	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	17.68	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	WASF3	Q9UPY6	502 aa		17.68	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		17.68	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		17.67	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	AURKA	O14965	403 aa		17.67	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	TNFSF14	O43557	240 aa		17.67	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	SIGLEC6	O43699	453 aa		17.67	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	USP12	O75317	370 aa		17.67	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	METTL18	O95568	372 aa		17.67	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	PYGL	P06737	847 aa		17.67	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		17.67	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	17.67	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	17.67	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		17.67	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	EID2B	Q96D98	161 aa		17.67	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	PDXP	Q96GD0	296 aa		17.67	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	MS4A14	Q96JA4	679 aa		17.67	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		17.67	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	LRRC61	Q9BV99	259 aa		17.67	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		17.67	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	TRABD	Q9H4I3	376 aa		17.67	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	FGF22	Q9HCT0	170 aa		17.67	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	RAD18	Q9NS91	495 aa		17.67	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	HACD3	Q9P035	362 aa		17.67	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	17.67	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		17.67	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	17.66	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902		E7EVH7	732 aa		17.66	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	TRIM38	O00635	465 aa		17.66	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	ASMTL	O95671	621 aa		17.66	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	ANXA6	P08133	673 aa		17.66	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		17.66	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	TEAD1	P28347	426 aa		17.66	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	LMAN1	P49257	510 aa		17.66	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	GNG11	P61952	73 aa		17.66	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	DAB2	P98082	770 aa		17.66	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	FOXC1	Q12948	553 aa		17.66	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	ELOC	Q15369	112 aa		17.66	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	17.66	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		17.66	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		17.66	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	TRIM74	Q86UV6	250 aa		17.66	■□□□□ 0.42
USP19-210	ENST00000465902	NLRP8	Q86W28	1048 aa		17.66	■□□□□ 0.42

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