RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 TMC7Q7Z402 723 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PIM3Q86V86 326 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ZSWIM9Q86XI8 627 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PELI3Q8N2H9 469 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 BBS5Q8N3I7 341 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PHTF2Q8N3S3 785 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SPATA6LQ8N4H0 392 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 FIBCD1Q8N539 461 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 OR4K2Q8NGD2 314 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 GIMAP7Q8NHV1 300 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 RHEBL1Q8TAI7 183 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 HMGCLL1Q8TB92 370 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 HERVK_113Q902F9 699 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ACDQ96AP0 544 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 MOCOSQ96EN8 888 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 IFT43Q96FT9 208 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TSPAN17Q96FV3 270 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 EXOC2Q96KP1 924 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 OR52B2Q96RD2 323 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 RAD9AQ99638 391 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC28BQ9BUN5 200 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 NACA2Q9H009 215 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 COG4Q9H9E3 785 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 MAGEE1Q9HCI5 957 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TRPC7Q9HCX4 862 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CATSPERZQ9NTU4 200 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ABCB8Q9NUT2 735 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 HACD3Q9P035 362 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 MARK1Q9P0L2 795 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CFAP97Q9P2B7 532 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TAGLN3Q9UI15 199 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 HS3ST2Q9Y278 367 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF510Q9Y2H8 683 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 INSL6Q9Y581 213 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CEP290O15078 2479 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 LRRK1Q38SD2 2015 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 DOCK8Q8NF50 2099 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 A0A0J9YYE9 177 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PRU2 124 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 LINC01553A4QN01 128 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 WASH3PC4AMC7 463 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 H0YHG0 523 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ST8SIA5O15466 376 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 NEBLO76041 1014 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 IPO13O94829 963 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CXCL14O95715 111 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 HSPA4LO95757 839 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 GLP2RO95838 553 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TRBC1P01850 177 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 FGBP02675 491 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ADH1AP07327 375 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 RBP1P09455 135 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC166P0CW27 439 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 KITP10721 976 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 NEFHP12036 1026 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SRCP12931 536 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 GNAZP19086 355 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TFEBP19484 476 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 IMPDH1P20839 514 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 LPOP22079 712 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.512e-7■■■□□ 15.8
PTPRC-210ENST00000462363 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 WEE1P30291 646 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SLC8A1P32418 973 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ELF1P32519 619 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 GCKP35557 465 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 HMGCLP35914 325 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 RASSF2P50749 326 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 RPL14P50914 215 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SCNN1BP51168 640 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PRAMEP78395 509 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 UBE3AQ05086 875 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 KLF10Q13118 480 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CSHL1Q14406 222 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 HERC3Q15034 1050 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 OR4D1Q15615 310 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF77Q15935 545 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SNCBQ16143 134 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 FAM83EQ2M2I3 478 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SLC5A9Q2M3M2 681 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 FUT11Q495W5 492 aa5.63□□□□□ -1.51
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