RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 MAFKO60675 156 aa26.27■■□□□ 1.8
PBRM1-218ENST00000458294 PGLSO95336 258 aa26.27■■□□□ 1.8
PBRM1-218ENST00000458294 GZMAP12544 262 aa26.27■■□□□ 1.8
PBRM1-218ENST00000458294 UGT1A3P35503 534 aa26.27■■□□□ 1.8
PBRM1-218ENST00000458294 PCK1P35558 622 aa26.27■■□□□ 1.8
PBRM1-218ENST00000458294 ACTR1BP42025 376 aa26.27■■□□□ 1.8
PBRM1-218ENST00000458294 GPR1P46091 355 aa26.27■■□□□ 1.8
PBRM1-218ENST00000458294 ACTR1AP61163 376 aa26.27■■□□□ 1.8
PBRM1-218ENST00000458294 GPLD1P80108 840 aa26.27■■□□□ 1.8
PBRM1-218ENST00000458294 ARMC12Q5T9G4 340 aa26.27■■□□□ 1.8
PBRM1-218ENST00000458294 NKAIN2Q5VXU1 208 aa26.27■■□□□ 1.8
PBRM1-218ENST00000458294 BORAQ6PGQ7 559 aa26.27■■□□□ 1.8
PBRM1-218ENST00000458294 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa26.27■■□□□ 1.8
PBRM1-218ENST00000458294 NSMCE1Q8WV22 266 aa26.27■■□□□ 1.8
PBRM1-218ENST00000458294 OR2M4Q96R27 311 aa26.27■■□□□ 1.8
PBRM1-218ENST00000458294 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa26.27■■□□□ 1.8
PBRM1-218ENST00000458294 KCNK4Q9NYG8 393 aa26.27■■□□□ 1.8
PBRM1-218ENST00000458294 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
PBRM1-218ENST00000458294 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa26.27■■□□□ 1.8
PBRM1-218ENST00000458294 SPTA1P02549 2419 aa26.27■■□□□ 1.8
PBRM1-218ENST00000458294 CSF2RBP32927 897 aa26.26■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 CDH6P55285 790 aa26.26■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 STX1AQ16623 288 aa26.26■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 TSPAN33Q86UF1 283 aa26.26■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 ART4Q93070 314 aa26.26■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 HSD3B7Q9H2F3 369 aa26.26■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 B4E171 279 aa26.25■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 SOD1P00441 154 aa26.25■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 FTLP02792 175 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 LIFP15018 202 aa26.25■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 AMPD1P23109 780 aa26.25■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 TSPAN7P41732 249 aa26.25■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 MMP13P45452 471 aa26.25■■□□□ 1.79
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PBRM1-218ENST00000458294 RAB15P59190 212 aa26.25■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 MAXP61244 160 aa26.25■■□□□ 1.79
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PBRM1-218ENST00000458294 BOLA3Q53S33 107 aa26.25■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 MARC1Q5VT66 337 aa26.25■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM71Q6P5X7 295 aa26.25■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 DOK6Q6PKX4 331 aa26.25■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa26.25■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 CLEC17AQ6ZS10 378 aa26.25■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 POLNQ7Z5Q5 900 aa26.25■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 NDUFAF2Q8N183 169 aa26.25■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 ATPAF2Q8N5M1 289 aa26.25■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 ETNK2Q9NVF9 386 aa26.25■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 SLC39A1Q9NY26 324 aa26.25■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 LRRC53A6NM62 1247 aa26.24■■□□□ 1.79
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PBRM1-218ENST00000458294 SERPINB6P35237 376 aa26.24■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 ASIC2Q16515 512 aa26.24■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 DCAF12Q5T6F0 453 aa26.24■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 NLRP8Q86W28 1048 aa26.24■■□□□ 1.79
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PBRM1-218ENST00000458294 HAUS4Q9H6D7 363 aa26.24■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 PDP2Q9P2J9 529 aa26.24■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 TUBD1Q9UJT1 453 aa26.24■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa26.24■■□□□ 1.79
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PBRM1-218ENST00000458294 IL1R2P27930 398 aa26.23■■□□□ 1.79
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PBRM1-218ENST00000458294 SMTNL2Q2TAL5 461 aa26.23■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 PYCR3Q53H96 274 aa26.23■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF765Q7L2R6 523 aa26.23■■□□□ 1.79
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PBRM1-218ENST00000458294 ZMYND15Q9H091 742 aa26.23■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP26.23■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 OCIAD1Q9NX40 245 aa26.23■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM9Q9P0T7 183 aa26.23■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 CD84Q9UIB8 345 aa26.23■■□□□ 1.79
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PBRM1-218ENST00000458294 KCNAB2Q13303 367 aa26.22■■□□□ 1.79
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PBRM1-218ENST00000458294 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
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PBRM1-218ENST00000458294 GALNT13Q8IUC8 556 aa26.22■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 HSPH1Q92598 858 aa26.22■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 SLC38A3Q99624 504 aa26.22■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa26.22■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 EFCAB7A8K855 629 aa26.21■■□□□ 1.79
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
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