RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449544.5

HCG18-238, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 4,262 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-238ENST00000449544 FAM96AQ9H5X1 160 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 PADI2Q9Y2J8 665 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 OR1A2Q9Y585 309 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 SPAG17Q6Q759 2223 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 J3KR12 359 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 LRCH4O75427 683 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 C6P13671 934 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 DGKAP23743 735 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 NPY2RP49146 381 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 CACNA2D1P54289 1103 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 WNT7BP56706 349 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 POU4F1Q01851 419 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 CAV1Q03135 178 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 TBCCQ15814 346 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 TRIM74Q86UV6 250 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 CNDP1Q96KN2 507 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 MRGPRX1Q96LB2 322 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 ZBTB18Q99592 522 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 ACTR8Q9H981 624 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 HRASLS2Q9NWW9 162 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 DLEC1Q9Y238 1755 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 PMM2O15305 246 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 MFSD11O43934 449 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 PPFIA2O75334 1257 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 POP7O75817 140 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 CCNDBP1O95273 360 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 STX1BP61266 288 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 GBE1Q04446 702 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 OLFML1Q6UWY5 402 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 SH2D3CQ8N5H7 860 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 ANKRD42Q8N9B4 389 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 ZMIZ2Q8NF64 920 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 WDR48Q8TAF3 677 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 AZIN2Q96A70 460 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 SNF8Q96H20 258 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 HIC2Q96JB3 615 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 CABS1Q96KC9 395 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 C1orf74Q96LT6 269 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 EFHD1Q9BUP0 239 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 FAM129AQ9BZQ8 928 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 IL21RQ9HBE5 538 aa8.43□□□□□ -1.06
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HCG18-238ENST00000449544 SIK3Q9Y2K2 1263 aa8.43□□□□□ -1.06
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HCG18-238ENST00000449544 MTX2O75431 263 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 CDC25BP30305 580 aa8.43□□□□□ -1.06
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HCG18-238ENST00000449544 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.43□□□□□ -1.06
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HCG18-238ENST00000449544 USP30Q70CQ3 517 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 OR56A4Q8NGH8 313 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 ATL1Q8WXF7 558 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 JADE3Q92613 823 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 SLC22A18Q96BI1 424 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 NXPE2Q96DL1 559 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 FIZ1Q96SL8 496 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
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HCG18-238ENST00000449544 FZD10Q9ULW2 581 aa8.43□□□□□ -1.06
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HCG18-238ENST00000449544 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 COX7A2P14406 83 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 CMPK1P30085 196 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 STX2P32856 288 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 HOXD13P35453 343 aa8.43□□□□□ -1.06
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HCG18-238ENST00000449544 LRRC66Q68CR7 880 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 FSTL4Q6MZW2 842 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 POLNQ7Z5Q5 900 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 CCNJLQ8IV13 435 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 CXorf38Q8TB03 319 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 DENND1AQ8TEH3 1009 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 RILPQ96NA2 401 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-238ENST00000449544 SMC6Q96SB8 1091 aa8.43□□□□□ -1.06
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