RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-222ENST00000449504 NDST2P52849 883 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 GFERP55789 205 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CETN1Q12798 172 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 IL11RAQ14626 422 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ARTNQ5T4W7 220 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 BRAT1Q6PJG6 821 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 SPNS3Q6ZMD2 512 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 SLC26A9Q7LBE3 791 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 SYVN1Q86TM6 617 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 HPS6Q86YV9 775 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 PLXDC1Q8IUK5 500 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 HCAR2Q8TDS4 363 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 FNIP1Q8TF40 1166 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 SH3KBP1Q96B97 665 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 TGM7Q96PF1 710 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 OR2M4Q96R27 311 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 TSG101Q99816 390 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 GPR87Q9BY21 358 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 NTNG1Q9Y2I2 539 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 HIVEP1P15822 2718 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 A0A1B0GVL5 298 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 TSPAN11A1L157 253 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CFAP69A5D8W1 941 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 SNX2O60749 519 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CEACAM4O75871 244 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 TIAF1O95411 115 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 RHOQP17081 205 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 TYRP1P17643 537 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 GM2AP17900 193 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 MAPKAPK2P49137 400 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 KRTAP10-9P60411 292 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CDK3Q00526 305 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 GCNT1Q02742 428 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CYTH1Q15438 398 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 VWA2Q5GFL6 755 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 TMCO4Q5TGY1 634 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 RAET1GQ6H3X3 334 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CDH24Q86UP0 819 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 PPP1R3BQ86XI6 285 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 DNAAF5Q86Y56 855 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 NXPE1Q8N323 547 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 SFRP1Q8N474 314 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 EHBP1Q8NDI1 1231 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 LMO3Q8TAP4 145 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 MR1Q95460 341 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 NUS1Q96E22 293 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 C9orf72Q96LT7 481 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 TEX101Q9BY14 249 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 MAGEB5Q9BZ81 275 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 KLC2Q9H0B6 622 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 BRD8Q9H0E9 1235 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 LHX3Q9UBR4 397 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 OR12D3Q9UGF7 316 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ANKRD36A6QL64 1941 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 APCP25054 2843 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 A0A1B0GUH1 482 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 FAM72CH0Y354 149 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ASMTLO95671 621 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 MYL1P05976 194 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 IVLP07476 585 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ANKRD34CP0C6C1 535 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 FGF5P12034 268 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 PFKFB1P16118 471 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 BPIP17213 487 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 AMD1P17707 334 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 HTR1EP28566 365 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 SERPINA4P29622 427 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 HDAC4P56524 1084 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 SNX16P57768 344 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ATP11AP98196 1134 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 PDE1BQ01064 536 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 ART3Q13508 389 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 CUL4AQ13619 759 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 GRM3Q14832 879 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 MEA1Q16626 185 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-222ENST00000449504 SLC25A52Q3SY17 297 aa7.12□□□□□ -1.27
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