RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC35F6Q8N357 371 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 RASGEF1CQ8N431 466 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 EID2Q8N6I1 236 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 OR56A4Q8NGH8 313 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 SCAMP4Q969E2 229 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 WDR24Q96S15 920 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 DUSP23Q9BVJ7 150 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 LGR4Q9BXB1 951 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR63Q9BZJ6 419 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC13A1Q9BZW2 595 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 ARNT2Q9HBZ2 717 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 UCKL1Q9NWZ5 548 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 CD84Q9UIB8 345 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 SHOC2Q9UQ13 582 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM202A6NGA9 273 aa16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 F5H423 210 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 CES2O00748 559 aa16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 METTL18O95568 372 aa16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 AGTP01019 485 aa16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 TNFP01375 233 aa16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 PIRTP0C851 137 aa16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 HMGCLP35914 325 aa16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 CHRNA4P43681 627 aa16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 DCDC1P59894 354 aa16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 KCTD11Q693B1 232 aa16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC25A41Q8N5S1 370 aa16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 OR4C6Q8NH72 309 aa16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 DTX3LQ8TDB6 740 aa16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 FICDQ9BVA6 458 aa16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 NLGN3Q9NZ94 848 aa16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 KLQ9UEF7 1012 aa16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 PYCARDQ9ULZ3 195 aa16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 SPO11Q9Y5K1 396 aa16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa16.78■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 USP27XA6NNY8 438 aa16.78■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 AQP9O43315 295 aa16.78■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 ADRB1P08588 477 aa16.78■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 ALPPL2P10696 532 aa16.78■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 ACTN2P35609 894 aa16.78■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 HS1BP3Q53T59 392 aa16.78■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 PDPK2PQ6A1A2 396 aa16.78■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 LVRNQ6Q4G3 990 aa16.78■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 HID1Q8IV36 788 aa16.78■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 TTC30BQ8N4P2 665 aa16.78■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM181AQ8N9Y4 354 aa16.78■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 LMX1AQ8TE12 382 aa16.78■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 COX14Q96I36 57 aa16.78■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 HIC2Q96JB3 615 aa16.78■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 AGAP2Q99490 1192 aa16.78■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 KCND1Q9NSA2 647 aa16.78■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP16.78■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 FTSJ1Q9UET6 329 aa16.78■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa16.78■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 LMO7DNF2Z398 122 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 TRIM38O00635 465 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 AURKAO14965 403 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 PPFIA2O75334 1257 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 DKK1O94907 266 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 TRIM16O95361 564 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 CEACAM5P06731 702 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 BPIP17213 487 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNA4P22459 653 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 FDFT1P37268 417 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 SNX1Q13596 522 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 ELOCQ15369 112 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 PRRT3Q5FWE3 981 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 DENND5AQ6IQ26 1287 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 C4orf22Q6V702 233 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 RBFAQ8N0V3 343 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 PRELID2Q8N945 189 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR26Q8NDV2 337 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 OR1E3Q8WZA6 343 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 C19orf43Q9BQ61 176 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 TBL1YQ9BQ87 522 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 LRRC61Q9BV99 259 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 CAAP1Q9H8G2 361 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 LRRC40Q9H9A6 602 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 FGF22Q9HCT0 170 aa16.77■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 IL17CQ9P0M4 197 aa16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms