RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZMYND15Q9H091 742 aa13.13□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHTF1Q9UMS5 762 aa13.13□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RELNP78509 3460 aa13.13□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM191CA6NGB0 347 aa13.12□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRCH4O75427 683 aa13.12□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PEX11BO96011 259 aa13.12□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNFAIP3P21580 790 aa13.12□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MPSTP25325 297 aa13.12□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HCAR3P49019 387 aa13.12□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPLD1P80108 840 aa13.12□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DPTQ07507 201 aa13.12□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNAB2Q13303 367 aa13.12□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SQSTM1Q13501 440 aa13.12□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q6ZVL8 140 aa13.12□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPAN33Q86UF1 283 aa13.12□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa13.12□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BBS5Q8N3I7 341 aa13.12□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa13.12□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM7Q9C029 511 aa13.12□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZWILCHQ9H900 591 aa13.12□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOD2Q9HC29 1040 aa13.12□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OCIAD1Q9NX40 245 aa13.12□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC39A1Q9NY26 324 aa13.12□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNK4Q9NYG8 393 aa13.12□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM9Q9P0T7 183 aa13.12□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa13.12□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EFCAB7A8K855 629 aa13.11□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 B4E171 279 aa13.11□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAD1O60671 282 aa13.11□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PGLSO95336 258 aa13.11□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOD1P00441 154 aa13.11□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP1A3P13637 1013 aa13.11□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPAN7P41732 249 aa13.11□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR1P46091 355 aa13.11□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB15P59190 212 aa13.11□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYL5Q02045 173 aa13.11□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RALGPS1Q5JS13 557 aa13.11□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM71Q6P5X7 295 aa13.11□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP45Q70EL2 814 aa13.11□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa13.11□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa13.11□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM129CQ86XR2 697 aa13.11□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCRN2Q96FV2 425 aa13.11□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPN3Q9H201 632 aa13.11□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TUBD1Q9UJT1 453 aa13.11□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H3BRJ5 948 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUX1O43812 170 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAFKO60675 156 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARL4AP40617 200 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FASLGP48023 281 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAXP61244 160 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTPRRQ15256 657 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DPYSL2Q16555 572 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCAF12Q5T6F0 453 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARMC12Q5T9G4 340 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKS6Q68DC2 871 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMCO3Q6UWJ1 677 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATPAF2Q8N5M1 289 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BMPERQ8N8U9 685 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CATSPER2Q96P56 530 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ETNK2Q9NVF9 386 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD84Q9UIB8 345 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FLNCQ14315 2725 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC10BA6NIK2 292 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTPS1P17812 591 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AMPD1P23109 780 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCK1P35558 622 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MMP13P45452 471 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCR10P46092 362 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDH6P55285 790 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRP8Q14114 963 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SKIDA1Q1XH10 827 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMTNL2Q2TAL5 461 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PYCR3Q53H96 274 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC66Q68CR7 880 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RFLNAQ6ZTI6 216 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM74Q86UV6 250 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GALNT13Q8IUC8 556 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NRSN1Q8IZ57 195 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SFRP1Q8N474 314 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR10G6Q8NH81 332 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC37A2Q8TED4 501 aa13.1□□□□□ -0.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NSMCE1Q8WV22 266 aa13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms