RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF883P0CG24 379 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 CYP2F1P24903 491 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 CD6P30203 668 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 ADSSP30520 456 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 LRPAP1P30533 357 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 ACTN2P35609 894 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 SERPINF1P36955 418 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 MAPK9P45984 424 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 NPTX2P47972 431 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 KCNJ5P48544 419 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 PDE6CP51160 858 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 TMPRSS3P57727 454 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 TLE3Q04726 772 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 SMARCB1Q12824 385 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 FOXE3Q13461 319 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 HES3Q5TGS1 186 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 DCAF12L1Q5VU92 463 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 WSCD1Q658N2 575 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 USP49Q70CQ1 688 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 PPP1R3BQ86XI6 285 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 CACUL1Q86Y37 369 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 CCDC150Q8NCX0 1101 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 LRRC15Q8TF66 581 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 SCFD1Q8WVM8 642 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 RAB24Q969Q5 203 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 TMEM176AQ96HP8 235 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 LRRC37BQ96QE4 947 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 SLC6A15Q9H2J7 730 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 SMURF2Q9HAU4 748 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 RASSF1Q9NS23 344 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 SACM1LQ9NTJ5 587 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 GJB4Q9NTQ9 266 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 DEC1Q9P2X7 70 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 SLC39A10Q9ULF5 831 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 RAD54BQ9Y620 910 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 RP1P56715 2156 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 TTC26A0AVF1 554 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 NPC1O15118 1278 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 PJA2O43164 708 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 SLC43A1O75387 559 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 TOM1L1O75674 476 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 MATN4O95460 622 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 ABHD16AO95870 558 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 CHEK2O96017 543 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 VSIG10L2P0DP72 767 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 ACADMP11310 421 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 CYP3A5P20815 502 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 RPS6KB1P23443 525 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 MCM7P33993 719 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 PTPN7P35236 360 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 KRT2P35908 639 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 TAF6P49848 677 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 CCT8P50990 548 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 BNC1Q01954 994 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 GAD2Q05329 585 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 SLC13A2Q13183 592 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 DNAJC3Q13217 504 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 SPARCL1Q14515 664 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 USP10Q14694 798 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 TMEM132DQ14C87 1099 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 TBR1Q16650 682 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 KIF19Q2TAC6 998 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 LY6G5CQ5SRR4 150 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 C9orf57Q5W0N0 161 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 JADE1Q6IE81 842 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 RHBDF2Q6PJF5 856 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 LAYNQ6UX15 382 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 SEM1Q6ZVN7 128 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 TAX1BP1Q86VP1 789 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 LIX1LQ8IVB5 337 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 FAM71BQ8TC56 605 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 MUL1Q969V5 352 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 MED8Q96G25 268 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 MTMR9Q96QG7 549 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 ADOQ96SZ5 270 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 ACOX2Q99424 681 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 HEPHQ9BQS7 1158 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 MAGEB5Q9BZ81 275 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 OR10A2Q9H208 303 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRK-210ENST00000415055 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms