RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 PACSIN3Q9UKS6 424 aa23.74■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 CHD5Q8TDI0 1954 aa23.74■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 CCDC162PA2VCL2 907 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 F5H5T6 163 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D4O60343 1298 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 TBX18O95935 607 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 ATP6V0D1P61421 351 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 PRMT9Q6P2P2 845 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 LILRA2Q8N149 483 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 CRIPAKQ8N1N5 446 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 TMEM199Q8N511 208 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 GCNAQ96QF7 691 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 TTLL2Q9BWV7 592 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 SEPT3Q9UH03 358 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 GREB1Q4ZG55 1949 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 MTMR11A4FU01 709 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 E7ENX8 843 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 MRASO14807 208 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 MAP3K13O43283 966 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 RFC2P35250 354 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 PLK1P53350 603 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 TLR1Q15399 786 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 COQ5Q5HYK3 327 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 FAM171A1Q5VUB5 890 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 NADSYN1Q6IA69 706 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 FBXL19Q6PCT2 694 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 SPATA24Q86W54 205 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 AHI1Q8N157 1196 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 TSPEARQ8WU66 669 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 KIAA1191Q96A73 305 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 KLHL32Q96NJ5 620 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 PSKH2Q96QS6 385 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 ATOH8Q96SQ7 321 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 SPATA16Q9BXB7 569 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 DERL2Q9GZP9 239 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 SLC24A3Q9HC58 644 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 TMCO1Q9UM00 188 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 KCTD3Q9Y597 815 aa23.73■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 VWA8A3KMH1 1905 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 H7C4K7 107 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 ACVRL1P37023 503 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 GOLM1Q8NBJ4 401 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 PKP2Q99959 881 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 CCDC167Q9P0B6 97 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 CRYL1Q9Y2S2 319 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 NDUFAF1Q9Y375 327 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD36A6QL64 1941 aa23.72■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa23.71■■□□□ 1.39
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PMS1-205ENST00000409985 SRP72O76094 671 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 MATN4O95460 622 aa23.71■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 GPX3P22352 226 aa23.71■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 ETFBP38117 255 aa23.71■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 GRIK2Q13002 908 aa23.71■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 KANK2Q63ZY3 851 aa23.71■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 ARPINQ7Z6K5 226 aa23.71■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
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PMS1-205ENST00000409985 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa23.71■■□□□ 1.39
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PMS1-205ENST00000409985 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa23.71■■□□□ 1.39
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PMS1-205ENST00000409985 AP4S1Q9Y587 144 aa23.71■■□□□ 1.39
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PMS1-205ENST00000409985 CDK14O94921 469 aa23.7■■□□□ 1.39
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PMS1-205ENST00000409985 CDH4P55283 916 aa23.7■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 PPP1R3AQ16821 1122 aa23.7■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 USP41Q3LFD5 358 aa23.7■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.7■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 PAOXQ6QHF9 649 aa23.7■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 AFTPHQ6ULP2 937 aa23.7■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 PIM3Q86V86 326 aa23.7■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 TTC9BQ8N6N2 239 aa23.7■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 OVCA2Q8WZ82 227 aa23.7■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 EFHD1Q9BUP0 239 aa23.7■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 ZNF696Q9H7X3 374 aa23.7■■□□□ 1.39
PMS1-205ENST00000409985 ENO4A6NNW6 628 aa23.7■■□□□ 1.38
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