RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409945.1

USP40-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP40, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-202ENST00000409945 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 BDP1A6H8Y1 2624 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 REV3LO60673 3130 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 WDR27A2RRH5 827 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 OR6C75A6NL08 312 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 ANKRD63C9JTQ0 380 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 M0QYT0 321 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 CALUO43852 315 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 VIPP01282 170 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 PYGLP06737 847 aa6.64□□□□□ -1.35
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USP40-202ENST00000409945 TKTP29401 623 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
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USP40-202ENST00000409945 SLC5A2P31639 672 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 TAF6P49848 677 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 ARPP19P56211 112 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 DEUP1Q05D60 604 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 MSANTD2Q6P1R3 559 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 SYCE2Q6PIF2 218 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 BRSK2Q8IWQ3 736 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 XXYLT1Q8NBI6 393 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 SUSD6Q92537 303 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 FKBP10Q96AY3 582 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 PAGE5Q96GU1 130 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 B3GALT6Q96L58 329 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 MECRQ9BV79 373 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 STRA6Q9BX79 667 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 DNAI2Q9GZS0 605 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 S1PR5Q9H228 398 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 BLZF1Q9H2G9 400 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 MTRRQ9UBK8 725 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 ITGA11Q9UKX5 1188 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 F8W810 466 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 YY2O15391 372 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 SPRY2O43597 315 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 EXOC3O60645 756 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 KINO60870 393 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 HUS1O60921 280 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 RPP40O75818 363 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 ACTL6BO94805 426 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 CER1O95813 267 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 RPN1P04843 607 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 ADRB2P07550 413 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 KRT19P08727 400 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 TNNI1P19237 187 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 TYMPP19971 482 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 BRCC3P46736 316 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 AP3M2P53677 418 aa6.63□□□□□ -1.35
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USP40-202ENST00000409945 SMARCB1Q12824 385 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 MTAPQ13126 283 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 STIM1Q13586 685 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 TAF12Q16514 161 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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USP40-202ENST00000409945 GALNT15Q8N3T1 639 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 EID2BQ96D98 161 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 SAAL1Q96ER3 474 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 PRR25Q96S07 402 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 GRPEL1Q9HAV7 217 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 CACNG4Q9UBN1 327 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 FBXW11Q9UKB1 542 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa6.63□□□□□ -1.35
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USP40-202ENST00000409945 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.62□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa6.62□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 I3L4J1 428 aa6.62□□□□□ -1.35
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USP40-202ENST00000409945 ZNF197O14709 1029 aa6.62□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 ZNF202O95125 648 aa6.62□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 FAM90A15PP0C7V4 464 aa6.62□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 FAM90A14PP0C7W9 464 aa6.62□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 PRKAR1BP31321 381 aa6.62□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 PPP1R2P41236 205 aa6.62□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 MAPK9P45984 424 aa6.62□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 NDUFA8P51970 172 aa6.62□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 TIRAPP58753 221 aa6.62□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 MYL7Q01449 175 aa6.62□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 TSPY1Q01534 308 aa6.62□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 TRPC3Q13507 836 aa6.62□□□□□ -1.35
USP40-202ENST00000409945 MYBPC2Q14324 1141 aa6.62□□□□□ -1.35
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