RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400060.8

PTPRM-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,030 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-203ENST00000400060 LIMK2P53671 638 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRM-203ENST00000400060 LIPEQ05469 1076 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRM-203ENST00000400060 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
PTPRM-203ENST00000400060 PTPRJQ12913 1337 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRM-203ENST00000400060 SWI5Q1ZZU3 235 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRM-203ENST00000400060 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRM-203ENST00000400060 FGD2Q7Z6J4 655 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRM-203ENST00000400060 COMMD7Q86VX2 200 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRM-203ENST00000400060 GLIS3Q8NEA6 775 aa9.96□□□□□ -0.81
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PTPRM-203ENST00000400060 ERLEC1Q96DZ1 483 aa9.96□□□□□ -0.81
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PTPRM-203ENST00000400060 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
PTPRM-203ENST00000400060 B3GNT2Q9NY97 397 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRM-203ENST00000400060 GGA3Q9NZ52 723 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRM-203ENST00000400060 SEC14L4Q9UDX3 406 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRM-203ENST00000400060 CORO2BQ9UQ03 480 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRM-203ENST00000400060 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPRM-203ENST00000400060 RAD17O75943 681 aa9.96□□□□□ -0.81
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PTPRM-203ENST00000400060 FABP12A6NFH5 140 aa9.96□□□□□ -0.82
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PTPRM-203ENST00000400060 MNTQ99583 582 aa9.96□□□□□ -0.82
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PTPRM-203ENST00000400060 MID1IP1Q9NPA3 183 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 TMEM161AQ9NX61 479 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 COX16Q9P0S2 106 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 ZNRF3Q9ULT6 936 aa9.96□□□□□ -0.82
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PTPRM-203ENST00000400060 GCATO75600 419 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 PRAMEF1O95521 474 aa9.95□□□□□ -0.82
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PTPRM-203ENST00000400060 CHRNEQ04844 493 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 PRKCDQ05655 676 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.821e-8■■■■■ 37.2
PTPRM-203ENST00000400060 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa9.95□□□□□ -0.82
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PTPRM-203ENST00000400060 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 GSTM5P46439 218 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRM-203ENST00000400060 PPP3CAQ08209 521 aa9.95□□□□□ -0.82
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