RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380701.7

CCDC171-201, Transcript of coiled-coil domain containing 171, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC171, Length 6,512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171-201ENST00000380701 SF1Q15637 639 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 EIPR1Q53HC9 387 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 FBXW10Q5XX13 1052 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 SULT1C3Q6IMI6 304 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 IL31RAQ8NI17 732 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 AP3S1Q92572 193 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 TPD52L3Q96J77 140 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 CCDC28BQ9BUN5 200 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 SEMA4AQ9H3S1 761 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 FZD8Q9H461 694 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 TTLL8A6PVC2 850 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 GABRDO14764 452 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 TPP1O14773 563 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 SLC7A4O43246 635 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 TREHO43280 583 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 SNAP91O60641 907 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 UGT2B4P06133 528 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 SLC6A2P23975 617 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 LRPAP1P30533 357 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 HCAR3P49019 387 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 PTPN5P54829 565 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 TLE2Q04725 743 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 FAM189A2Q15884 450 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 HSDL1Q3SXM5 330 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 MTX3Q5HYI7 312 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 MED27Q6P2C8 311 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 OTOP2Q7RTS6 562 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 KBTBD8Q8NFY9 601 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 OR5B17Q8NGF7 314 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 COL26A1Q96A83 441 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 NACC2Q96BF6 587 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 YIPF3Q9GZM5 350 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 GBA3Q9H227 469 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 SPAG4Q9NPE6 437 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 INSIG1O15503 277 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 TM7SF2O76062 418 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 SOX30O94993 753 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 MAGEA11P43364 429 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 ARNTL2Q8WYA1 636 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 FAM136AQ96C01 138 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 SUSD3Q96L08 255 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 NSMCE3Q96MG7 304 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 VPS35Q96QK1 796 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 PSKH2Q96QS6 385 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 PCDH10Q9P2E7 1040 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 GMEB2Q9UKD1 530 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 CPQQ9Y646 472 aa7.15□□□□□ -1.26
CCDC171-201ENST00000380701 ILVBLA1L0T0 632 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 DHX15O43143 795 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 ITGA2BP08514 1039 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 PRG2P13727 222 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 GOT1P17174 413 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 EPORP19235 508 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 ZNF33AQ06730 810 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 RALGDSQ12967 914 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 ABRQ12979 859 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 TMEM154Q6P9G4 183 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 VITQ6UXI7 678 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 KCNK18Q7Z418 384 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 STK32CQ86UX6 486 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 SNX32Q86XE0 403 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 EFCAB10A6NFE3 127 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 ARL5CA6NH57 179 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 TRIM38O00635 465 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 RB1P06400 928 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 NUDT17P0C025 328 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 PFKLP17858 780 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 TARSP26639 723 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 SSTR1P30872 391 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 CPA2P48052 419 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 GYS2P54840 703 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 OLR1P78380 273 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 HEPACAMQ14CZ8 416 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 CARD16Q5EG05 197 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 PDZK1Q5T2W1 519 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 DBF4BQ8NFT6 615 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 ZNF671Q8TAW3 534 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 C5orf34Q96MH7 638 aa7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.7 ms