RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 SEMA3CQ99985 751 aa23.87■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 MFSD1Q9H3U5 465 aa23.87■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa23.87■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM181Q9P2C4 612 aa23.87■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 TET1Q8NFU7 2136 aa23.87■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 H3BSA7 217 aa23.87■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 MRASO14807 208 aa23.87■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 S1PR4O95977 384 aa23.87■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa23.87■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 COL6A1P12109 1028 aa23.87■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 RING1Q06587 406 aa23.87■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 PPP1R3AQ16821 1122 aa23.87■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 UBXN10Q96LJ8 280 aa23.87■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa23.87■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 TLR5O60602 858 aa23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 TRMUO75648 421 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 ALDH2P05091 517 aa23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 RBP1P09455 135 aa23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 TACR2P21452 398 aa23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 PCSK6P29122 969 aa23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 CDKN2DP55273 166 aa23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 HPCAP84074 193 aa23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 MTX3Q5HYI7 312 aa23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 C6orf10Q5SRN2 563 aa23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM207Q6UWW9 146 aa23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 TAS1R1Q7RTX1 841 aa23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 GALNT7Q86SF2 657 aa23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 CFAP52Q8N1V2 620 aa23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 CROTQ9UKG9 612 aa23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 PRAMEF11O60813 436 aa23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 SRP72O76094 671 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 SELPP16109 830 aa23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 HDCP19113 662 aa23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 PTPRCAPQ14761 206 aa23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC22A9Q8IVM8 553 aa23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 TRIML2Q8N7C3 387 aa23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 CD99L2Q8TCZ2 262 aa23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM79Q9BSE2 394 aa23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 PNPLA3Q9NST1 481 aa23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 MYRFQ9Y2G1 1151 aa23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 VWA7Q9Y334 891 aa23.86■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 A0A1B0GTW7 788 aa23.85■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 NRP2O60462 931 aa23.85■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 ARSAP15289 507 aa23.85■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 PRAMEP78395 509 aa23.85■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 TSPAN17Q96FV3 270 aa23.85■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 PDFQ9HBH1 243 aa23.85■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 CIDEBQ9UHD4 219 aa23.85■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 ACTL7AQ9Y615 435 aa23.85■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 CHD5Q8TDI0 1954 aa23.85■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 A0A0D9SEW6 157 aa23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 H3BNH8 94 aa23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 CDK4P11802 303 aa23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 ATF6P18850 670 aa23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 RANBP1P43487 201 aa23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 ALDH3B2P48448 385 aa23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 MAPKAPK2P49137 400 aa23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP4BP51164 291 aa23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 ACAP2Q15057 778 aa23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 TCTN1Q2MV58 587 aa23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 TBATAQ96M53 351 aa23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC29A1Q99808 456 aa23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 TRMOQ9BU70 441 aa23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 ARL5AQ9Y689 179 aa23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC6A4P31645 630 aa23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 ACADVLP49748 655 aa23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 PLK1P53350 603 aa23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 KRT80Q6KB66 452 aa23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 HMBOX1Q6NT76 420 aa23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 CYP2R1Q6VVX0 501 aa23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 PIM3Q86V86 326 aa23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 LGI2Q8N0V4 545 aa23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 CIB1Q99828 191 aa23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKRD60Q9BZ19 345 aa23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 TRAF6Q9Y4K3 522 aa23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 ARVCFO00192 962 aa23.83■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 STAMBPO95630 424 aa23.83■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 TUBA4AP68366 448 aa23.83■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 GALNT3Q14435 633 aa23.83■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 TBC1D25Q3MII6 688 aa23.83■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 DHFR2Q86XF0 187 aa23.83■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 MYO1HQ8N1T3 1032 aa23.83■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKFN1Q8N957 763 aa23.83■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 OR52K2Q8NGK3 314 aa23.83■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
AMIGO1-201ENST00000369862 HHIPL1Q96JK4 782 aa23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms