RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 SNAPC3Q92966 411 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 PIGTQ969N2 578 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZIM3Q96PE6 472 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 PSD2Q9BQI7 771 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 NEURL2Q9BR09 285 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCNN2Q9H2S1 579 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 KAT14Q9H8E8 782 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 STARD7Q9NQZ5 370 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 THAP1Q9NVV9 213 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 POLG2Q9UHN1 485 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 DAPP1Q9UN19 280 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 CNPY2Q9Y2B0 182 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A087WW49 117 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 C5orf60A6NFR6 353 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 VSTM5A8MXK1 200 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLCO1B7G3V0H7 640 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 CEP104O60308 925 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRMUO75648 421 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 FGF18O76093 207 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 SCGB1D2O95969 90 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGHV3-13P01766 116 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGKV3-11P04433 115 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 HMBSP08397 361 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ACADMP11310 421 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 CSF2RAP15509 400 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 CEBPBP17676 345 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 GNAZP19086 355 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAOAP21397 527 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 UGT1A4P22310 534 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 BDKRB2P30411 391 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 AHRP35869 848 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 WNT5AP41221 380 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 HNF4AP41235 474 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 NR2C2P49116 596 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARHGAP8P85298 464 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 NDPQ00604 133 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 RUNX2Q13950 521 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 KIR2DS3Q14952 304 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRT24Q2M2I5 525 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 C15orf32Q32M92 178 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 GTDC1Q4AE62 458 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM35AQ53FP2 167 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 SH2D4BQ5SQS7 431 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 TTC22Q5TAA0 569 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 NXNQ6DKJ4 435 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 TTI2Q6NXR4 508 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 GJB7Q6PEY0 223 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 TAOK1Q7L7X3 1001 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 RTN4RL2Q86UN3 420 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCNMB4Q86W47 210 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHD1LQ86WJ1 897 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 GATAD2AQ86YP4 633 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 GHDCQ8N2G8 530 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 POM121L12Q8N7R1 296 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 SCCPDHQ8NBX0 429 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 DNAAF1Q8NEP3 725 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRSS33Q8NF86 280 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF721Q8TF20 911 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 GDPD5Q8WTR4 605 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZFAND2BQ8WV99 257 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 NCSTNQ92542 709 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF566Q969W8 418 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 TWNKQ96RR1 684 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 SYT15Q9BQS2 421 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLSTN3Q9BQT9 956 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHRDL1Q9BU40 450 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 CTDSP1Q9GZU7 261 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 MMP25Q9NPA2 562 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 TM7SF3Q9NS93 570 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 LRWD1Q9UFC0 647 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 RCOR1Q9UKL0 485 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 PADI3Q9ULW8 664 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 JRKLQ9Y4A0 524 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 STON1Q9Y6Q2 735 aa0.48□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms