RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa16.8■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa16.8■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 LRRC4Q9HBW1 653 aa16.8■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 TLR9Q9NR96 1032 aa16.8■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 ACOT9Q9Y305 439 aa16.8■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 DOCK3Q8IZD9 2030 aa16.79■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 CRHBPP24387 322 aa16.79■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 SLC6A3Q01959 620 aa16.79■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 BNIP2Q12982 314 aa16.79■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 PAGE2BQ5JRK9 111 aa16.79■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 FAM209AQ5JX71 171 aa16.79■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 CMTM6Q9NX76 183 aa16.79■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 MAP10Q9P2G4 905 aa16.79■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 V9GYQ6 96 aa16.79■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 UGT2B11O75310 529 aa16.79■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 PGK1P00558 417 aa16.79■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 GPIP06744 558 aa16.79■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 CHRM3P20309 590 aa16.79■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 LMO2P25791 158 aa16.79■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 CTF1Q16619 201 aa16.79■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 IFNEQ86WN2 208 aa16.79■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 KIAA2013Q8IYS2 634 aa16.79■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 SCML4Q8N228 414 aa16.79■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 VMP1Q96GC9 406 aa16.79■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 GPR78Q96P69 363 aa16.79■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 RHOJQ9H4E5 214 aa16.79■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 COL1A2P08123 1366 aa16.79■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 H0YAE9 185 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 NUAK1O60285 661 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 RECQL4O94761 1208 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 HSD17B1P14061 328 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 KYAT1Q16773 422 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 SOWAHAQ2M3V2 549 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 GPR142Q7Z601 462 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 SPNS2Q8IVW8 549 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 CEP97Q8IW35 865 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 CALML6Q8TD86 181 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 SLC35F5Q8WV83 523 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 HDAC11Q96DB2 347 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 GMIPQ9P107 970 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 BAG5Q9UL15 447 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 USP3Q9Y6I4 520 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 NOTOA8MTQ0 251 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 LDLRP01130 860 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 HTR1AP08908 422 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 TPH1P17752 444 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 HADHAP40939 763 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 SLC13A2Q13183 592 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 IMPG1Q17R60 797 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 PKDCCQ504Y2 493 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 PYCR3Q53H96 274 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 CUZD1Q86UP6 607 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 TP53INP2Q8IXH6 220 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 SLC22A17Q8WUG5 538 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 BRI3BPQ8WY22 251 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 HTRA1Q92743 480 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 PRDM12Q9H4Q4 367 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 KIAA1257Q9ULG3 409 aa16.78■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 FXYD1O00168 92 aa16.77■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 TNFRSF10AO00220 468 aa16.77■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 NCK1P16333 377 aa16.77■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 NMBRP28336 390 aa16.77■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 ARL4AP40617 200 aa16.77■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 STX1BP61266 288 aa16.77■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 LRIT3Q3SXY7 679 aa16.77■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 VPS26BQ4G0F5 336 aa16.77■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 DUSP28Q4G0W2 176 aa16.77■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 SLC27A1Q6PCB7 646 aa16.77■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa16.77■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 GOLM1Q8NBJ4 401 aa16.77■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 A0A0J9YYE9 177 aa16.77■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 ILVBLA1L0T0 632 aa16.77■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 CAPN15O75808 1086 aa16.77■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 NAT1P18440 290 aa16.77■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 SNX17Q15036 470 aa16.77■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 KIF19Q2TAC6 998 aa16.77■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 ARMC8Q8IUR7 673 aa16.77■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 NPLOC4Q8TAT6 608 aa16.77■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 TXNDC15Q96J42 360 aa16.77■□□□□ 0.28
GDE1-201ENST00000353258 RGS13O14921 159 aa16.77■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 NADKO95544 446 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 AP2A1O95782 977 aa16.77■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 KCNA5P22460 613 aa16.77■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 ALDH4A1P30038 563 aa16.77■□□□□ 0.27
GDE1-201ENST00000353258 GLUD2P49448 558 aa16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms