RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 ISCA2Q86U28 154 aa17.84■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP17.84■□□□□ 0.451e-24■■■□□ 16.3
ACTB-201ENST00000331789 LRRC3BQ96PB8 259 aa17.84■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 LRMDAQ9H2I8 198 aa17.84■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 COG4Q9H9E3 785 aa17.84■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 PIDD1Q9HB75 910 aa17.84■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 CYP4F12Q9HCS2 524 aa17.84■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 GALPQ9UBC7 116 aa17.84■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 MED16Q9Y2X0 877 aa17.84■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 RAP2CQ9Y3L5 183 aa17.84■□□□□ 0.45
ACTB-201ENST00000331789 SCN8AQ9UQD0 1980 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 A8MX80 341 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 ZNF197O14709 1029 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 SOCS5O75159 536 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 HMGCLP35914 325 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 DNAJB13P59910 316 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 RPL26P61254 145 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 ERVK-21P61565 698 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 KRT72Q14CN4 511 aa17.83■□□□□ 0.44
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ACTB-201ENST00000331789 TRIM67Q6ZTA4 783 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 TREML1Q86YW5 311 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 MAPK15Q8TD08 544 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 PTERQ96BW5 349 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 BIRC8Q96P09 236 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 POPDC3Q9HBV1 291 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 SLC25A13Q9UJS0 675 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 FAM50BQ9Y247 325 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 A8MT66 165 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 CAPN14A8MX76 684 aa17.82■□□□□ 0.44
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ACTB-201ENST00000331789 DIAPH2O60879 1101 aa17.82■□□□□ 0.44
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ACTB-201ENST00000331789 SERPINA4P29622 427 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 SEMG2Q02383 582 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 ASPHQ12797 758 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 CDKN3Q16667 212 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 FAM91A1Q658Y4 838 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 CYB5D1Q6P9G0 228 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 EPGNQ6UW88 154 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 ADIPOR2Q86V24 386 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 INPP5DQ92835 1189 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 CCDC106Q9BWC9 280 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 CCDC68Q9H2F9 335 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 STK38LQ9Y2H1 464 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 CHD7Q9P2D1 2997 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 SERPINA6P08185 405 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 PBX2P40425 430 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 TTPAP49638 278 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 RPL14P50914 215 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 ECT2LQ008S8 904 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 CFAP157Q5JU67 520 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 TMEM215Q68D42 235 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 PAQR3Q6TCH7 311 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 PHF21BQ96EK2 531 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 TUBB6Q9BUF5 446 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 KLC4Q9NSK0 619 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 H3BMM5 538 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 NPHS1O60500 1241 aa17.81■□□□□ 0.44
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ACTB-201ENST00000331789 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 TCF3P15923 654 aa17.81■□□□□ 0.44
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ACTB-201ENST00000331789 CACNG1Q06432 222 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 PRKAA1Q13131 559 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 CARD16Q5EG05 197 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 CTSL3PQ5NE16 218 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 FAM151BQ6UXP7 276 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 TMC5Q6UXY8 1006 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 RSPRY1Q96DX4 576 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 GPR21Q99679 349 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 SLC30A3Q99726 388 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 HTATIP2Q9BUP3 242 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 TAS2R13Q9NYV9 303 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-201ENST00000331789 DPP7Q9UHL4 492 aa17.81■□□□□ 0.44
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