RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324727.8

SCN4B-201, Transcript of sodium voltage-gated channel beta subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCN4B, Length 4,484 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4B-201ENST00000324727 NR6A1Q15406 480 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 UGT3A1Q6NUS8 523 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 SCIMPQ6UWF3 145 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 ALLCQ8N6M5 410 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 FBXO22Q8NEZ5 403 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 SPATA22Q8NHS9 363 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 ATP6V1HQ9UI12 483 aa11.65□□□□□ -0.54
SCN4B-201ENST00000324727 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 GABBR2O75899 941 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TSHRP16473 764 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 CHRNB2P17787 502 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 APLP1P51693 650 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 CLCN2P51788 898 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 GNA12Q03113 381 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TNK2Q07912 1038 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 BNIP3Q12983 259 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 SPRED3Q2MJR0 410 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 PGS1Q32NB8 556 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 GRTP1Q5TC63 336 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ZNF276Q8N554 614 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 KBTBD8Q8NFY9 601 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 FAR1Q8WVX9 515 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 HDAC10Q969S8 669 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 C7orf26Q96N11 449 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 CYP2S1Q96SQ9 504 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 SYTL2Q9HCH5 934 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 MYADML2A6NDP7 307 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TSPAN4O14817 238 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 C8AP07357 584 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 HOXD13P35453 343 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 PTPRNQ16849 979 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 LRRC73Q5JTD7 316 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 DGKKQ5KSL6 1271 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 SYPL2Q5VXT5 272 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 XKR5Q6UX68 686 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 OOSP2Q86WS3 158 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ELMO1Q92556 727 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 KLHL31Q9H511 634 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ARMC7Q9H6L4 198 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 BRD9Q9H8M2 597 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TAS2R13Q9NYV9 303 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 C5orf58C9J3I9 102 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 FBP2O00757 339 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 MFSD11O43934 449 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 UGT2B4P06133 528 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 LAG3P18627 525 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 CYP4F8P98187 520 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ANGPT1Q15389 498 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TAC4Q86UU9 113 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 DSELQ8IZU8 1212 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 RNFT2Q96EX2 444 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 RNF38Q9H0F5 515 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ELOVL6Q9H5J4 265 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 PHF24Q9UPV7 400 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ALDH9A1P49189 494 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 C11orf91Q3C1V1 193 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ATAD3BQ5T9A4 648 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 MZT2BQ6NZ67 158 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 SPESP1Q6UW49 350 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ZDHHC24Q6UX98 284 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 CMC1Q7Z7K0 106 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TNS4Q8IZW8 715 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 OR52K2Q8NGK3 314 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TNKS2Q9H2K2 1166 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ALG9Q9H6U8 611 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 KRT84Q9NSB2 600 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 MBD2Q9UBB5 411 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 CPQQ9Y646 472 aa11.64□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 MEIS3P2A8K0S8 358 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 H0YGN5 161 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TMCC2O75069 709 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 SLC7A2P52569 658 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 THOP1P52888 689 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 SMU1Q2TAY7 513 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 FBXO48Q5FWF7 155 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 LRRC38Q5VT99 294 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 FAM126BQ8IXS8 530 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TBC1D19Q8N5T2 526 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 LRRC20Q8TCA0 184 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ACAT2Q9BWD1 397 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 SIX2Q9NPC8 291 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 EGFL7Q9UHF1 273 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 GNPTGQ9UJJ9 305 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 PLLPQ9Y342 182 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms