RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315423.11

TNIP2-201, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNIP2, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP2-201ENST00000315423 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 CYHR1Q6ZMK1 362 aa25.06■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 GK5Q6ZS86 529 aa25.06■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 PDSS2Q86YH6 399 aa25.06■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 HMGCLL1Q8TB92 370 aa25.06■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 STAG3L4Q8TBR4 150 aa25.06■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 C19orf60Q96EN9 201 aa25.06■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 KLHL4Q9C0H6 718 aa25.06■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 RNF38Q9H0F5 515 aa25.06■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 VCXQ9H320 206 aa25.06■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 MED16Q9Y2X0 877 aa25.06■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 OBSL1O75147 1896 aa25.06■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 GPC4O75487 556 aa25.05■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 ACADVLP49748 655 aa25.05■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 RAD51Q06609 339 aa25.05■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 PLD1Q13393 1074 aa25.05■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 TAF12Q16514 161 aa25.05■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 UGT3A2Q3SY77 523 aa25.05■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 TMEM126BQ8IUX1 230 aa25.05■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 PLCD3Q8N3E9 789 aa25.05■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 LPCAT1Q8NF37 534 aa25.05■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 PPP2R3CQ969Q6 453 aa25.05■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 ANKRD66B4E2M5 251 aa25.05■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 H7C0S8 307 aa25.05■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 UBXN8O00124 270 aa25.05■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 SRP72O76094 671 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 TMCC1O94876 653 aa25.05■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 PYGLP06737 847 aa25.05■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 TTPAP49638 278 aa25.05■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa25.05■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 HIPK4Q8NE63 616 aa25.05■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 UCMAQ8WVF2 138 aa25.05■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 GATA6Q92908 595 aa25.05■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 MAGEA13PA6NCF6 341 aa25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 C1RP00736 705 aa25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 DPP6P42658 865 aa25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 CCL23P55773 120 aa25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 RPL26P61254 145 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 CLEC6AQ6EIG7 209 aa25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 GDPD5Q8WTR4 605 aa25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 NPAS2Q99743 824 aa25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 SLC25A23Q9BV35 468 aa25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 UNC93B1Q9H1C4 597 aa25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 C2orf78A6NCI8 922 aa25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 SYCE1LA8MT33 242 aa25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 TRIM38O00635 465 aa25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 CDK14O94921 469 aa25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 CD160O95971 181 aa25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 PRSS56P0CW18 603 aa25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 IRF1P10914 325 aa25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 PPP1R3AQ16821 1122 aa25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 NCEH1Q6PIU2 408 aa25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 PAQR3Q6TCH7 311 aa25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 HACD2Q6Y1H2 254 aa25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 EXT2Q93063 718 aa25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 SCOCQ9UIL1 159 aa25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 COMMD10Q9Y6G5 202 aa25.04■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 TSPAN3O60637 253 aa25.03■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 FMO4P31512 558 aa25.03■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 SH3BP2P78314 561 aa25.03■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 TRAF2Q12933 501 aa25.03■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 PFKFB4Q16877 469 aa25.03■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 AGKQ53H12 422 aa25.03■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 KANK2Q63ZY3 851 aa25.03■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 TMEM154Q6P9G4 183 aa25.03■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 PQLC1Q8N2U9 271 aa25.03■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 TTC30BQ8N4P2 665 aa25.03■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 WBP2Q969T9 261 aa25.03■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa25.03■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 LHX3Q9UBR4 397 aa25.03■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 TMCO1Q9UM00 188 aa25.03■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa25.03■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 CFLARO15519 480 aa25.02■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 UPP2O95045 317 aa25.02■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 GFAPP14136 432 aa25.02■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 CLCN4P51793 760 aa25.02■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 PKNOX1P55347 436 aa25.02■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 LRP8Q14114 963 aa25.02■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 C16orf59Q7L2K0 433 aa25.02■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 TOP1MTQ969P6 601 aa25.02■■□□□ 1.6
TNIP2-201ENST00000315423 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms