RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262829.11

RBFOX2-201, Transcript of RNA binding fox-1 homolog 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RBFOX2, Length 1,538 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2-201ENST00000262829 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa14.51□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 ALG6Q9Y672 507 aa14.51□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 DUSP10Q9Y6W6 482 aa14.51□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 SLC4A1P02730 911 aa14.51□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 CDKN2BP42772 138 aa14.51□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 GPR1P46091 355 aa14.51□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 GABREP78334 506 aa14.51□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 CCL7P80098 99 aa14.51□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 ISXQ2M1V0 245 aa14.51□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 C3orf38Q5JPI3 329 aa14.51□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa14.51□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 SPATA22Q8NHS9 363 aa14.51□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 PATE1Q8WXA2 126 aa14.51□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 AP2M1Q96CW1 435 aa14.51□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 FOXP3Q9BZS1 431 aa14.51□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 C10orf88Q9H8K7 445 aa14.51□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 UBP1Q9NZI7 540 aa14.51□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 INTUQ9ULD6 942 aa14.51□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 SUFUQ9UMX1 484 aa14.51□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 SATB2Q9UPW6 733 aa14.51□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 PPIL1Q9Y3C6 166 aa14.51□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 PRKAB1Q9Y478 270 aa14.51□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa14.5□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 CAPN8A6NHC0 703 aa14.5□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 CST8O60676 142 aa14.5□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 KELP23276 732 aa14.5□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 SLC1A1P43005 524 aa14.5□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 STC1P52823 247 aa14.5□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 MAZP56270 477 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 CCDC173Q0VFZ6 552 aa14.5□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 QPCTQ16769 361 aa14.5□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 LRRC38Q5VT99 294 aa14.5□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 SLC30A9Q6PML9 568 aa14.5□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa14.5□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa14.5□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 NRROSQ86YC3 692 aa14.5□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 KRT35Q92764 455 aa14.5□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 FATE1Q969F0 183 aa14.5□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 OLFM3Q96PB7 478 aa14.5□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 HEMGNQ9BXL5 484 aa14.5□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 ARFGAP3Q9NP61 516 aa14.5□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa14.5□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 MGAQ8IWI9 3026 aa14.49□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 TNFRSF10CO14798 259 aa14.49□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 NOBOXO60393 691 aa14.49□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 LCA5LO95447 670 aa14.49□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 CES1P23141 567 aa14.49□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 NFKBIAP25963 317 aa14.49□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 PDX1P52945 283 aa14.49□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 PDK1Q15118 436 aa14.49□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 TCEAL1Q15170 157 aa14.49□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 SPA17Q15506 151 aa14.49□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 LVRNQ6Q4G3 990 aa14.49□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa14.49□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.49□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 NDUFAF2Q8N183 169 aa14.49□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 GPR156Q8NFN8 814 aa14.49□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 NAT6Q93015 286 aa14.49□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 EID2BQ96D98 161 aa14.49□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 SHOC2Q9UQ13 582 aa14.49□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 RNF215Q9Y6U7 377 aa14.49□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 UNC13CQ8NB66 2214 aa14.49□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 CACNA1GO43497 2377 aa14.48□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa14.48□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 A0A1W2PQM1 296 aa14.48□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 ZNF487B1APH4 448 aa14.48□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 PSMD11O00231 422 aa14.48□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 PMPCBO75439 489 aa14.48□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 ADCY8P40145 1251 aa14.48□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 CTBSQ01459 385 aa14.48□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 SPIDRQ14159 915 aa14.48□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 NOMO1Q15155 1222 aa14.48□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 RAD9BQ6WBX8 426 aa14.48□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 DAAM2Q86T65 1068 aa14.48□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa14.48□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 ACRBPQ8NEB7 543 aa14.48□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 WDR24Q96S15 920 aa14.48□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 TAAR2Q9P1P5 351 aa14.48□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 AMACRQ9UHK6 382 aa14.48□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 A0A0U1RQJ8 604 aa14.47□□□□□ -0.09
RBFOX2-201ENST00000262829 FADS2P1A8MWK0 482 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms