RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 TWIST2Q8WVJ9 160 aa21.19■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC39A8Q9C0K1 460 aa21.19■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa21.19■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 NDUFAF1Q9Y375 327 aa21.19■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRIM17Q9Y577 477 aa21.19■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 A0A087X1B8 175 aa21.19■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 GLTPD2A6NH11 291 aa21.19■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC25A27O95847 323 aa21.19■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCNA2P20248 432 aa21.19■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 SCNN1AP37088 669 aa21.19■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 NFYCQ13952 458 aa21.19■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 UTS2BQ765I0 119 aa21.19■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa21.19■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 DPF3Q92784 378 aa21.19■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 TNIP3Q96KP6 325 aa21.19■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 MRGPRX2Q96LB1 330 aa21.19■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 KLHL5Q96PQ7 755 aa21.19■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 H0Y858 1186 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 CDH3P22223 829 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 PGFP49763 221 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 LIPEQ05469 1076 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRPV3Q8NET8 790 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 C16orf70Q9BSU1 422 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 TLR9Q9NR96 1032 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 IDUAP35475 653 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 ATP6V0D1P61421 351 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 LSM3P62310 102 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 POU4F1Q01851 419 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCL15Q16663 113 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 ISCA2Q86U28 154 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 PPP1R14BQ96C90 147 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 TREX1Q9NSU2 369 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 ASPDHA6ND91 283 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 A8MU76 341 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 CFAP99D6REC4 459 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 OPRL1P41146 370 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 FPGSQ05932 587 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 LAPTM5Q13571 262 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPCS2Q15005 226 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 TIGD2Q4W5G0 525 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 LINC00523Q86TU6 105 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 MIER2Q8N344 545 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC35B4Q969S0 331 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 ALG2Q9H553 416 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 CPA4Q9UI42 421 aa21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 TTC3P53804 2025 aa21.17■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 BCL10O95999 233 aa21.17■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 RFC2P35250 354 aa21.17■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 CARTPTQ16568 116 aa21.17■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa21.17■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa21.17■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 PCED1BQ96HM7 432 aa21.17■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 NANOGQ9H9S0 305 aa21.17■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 AASSQ9UDR5 926 aa21.17■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 NCAM2O15394 837 aa21.17■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 NOL3O60936 208 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 OXCT1P55809 520 aa21.17■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR4D2P58180 307 aa21.17■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 IHHQ14623 411 aa21.17■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 PSMD5Q16401 504 aa21.17■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa21.17■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 ACOX2Q99424 681 aa21.17■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 HEPHQ9BQS7 1158 aa21.17■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 ING2Q9H160 280 aa21.17■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM247A6NEH6 219 aa21.16■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 IMPDH1P20839 514 aa21.16■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 WNT3AP56704 352 aa21.16■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 UFM1P61960 85 aa21.16■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 AQP6Q13520 282 aa21.16■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 ACAP2Q15057 778 aa21.16■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR4D1Q15615 310 aa21.16■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARL13BQ3SXY8 428 aa21.16■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPRED1Q7Z699 444 aa21.16■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa21.16■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM125Q96AQ2 219 aa21.16■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 PKD2L2Q9NZM6 624 aa21.16■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 ACTR3BQ9P1U1 418 aa21.16■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 POLG2Q9UHN1 485 aa21.16■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 UTS2RQ9UKP6 389 aa21.16■□□□□ 0.98
CSNK1G2-201ENST00000255641 NRCAMQ92823 1304 aa21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms