RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237014.7

TTR-201, Transcript of transthyretin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTR, Length 957 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-201ENST00000237014 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa7.3□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa7.3□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.3□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 RP1P56715 2156 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 MYLKQ15746 1914 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 A0A1W2PQ67 120 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 FAM221BA6H8Z2 402 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 PSMD11O00231 422 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 TOR1BO14657 336 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 CASC3O15234 703 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 AQP9O43315 295 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 TRIM16O95361 564 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 FTCDO95954 541 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 APOC2P02655 101 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 FUCA1P04066 466 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 PYGMP11217 842 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 PTPN7P35236 360 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 NR2C2P49116 596 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 STC1P52823 247 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 THOP1P52888 689 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 KIAA1024LP59773 190 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 C1orf61Q13536 156 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 TFDP2Q14188 446 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 GALNT3Q14435 633 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 ACOX1Q15067 660 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 NOMO1Q15155 1222 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 TCEA2Q15560 299 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 QPCTQ16769 361 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 TEX44Q53QW1 395 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 CCDC157Q569K6 752 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 DENND2CQ68D51 928 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 DHRS13Q6UX07 377 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 USP45Q70EL2 814 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 KIAA1328Q86T90 577 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 CCDC50Q8IVM0 306 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 RCOR2Q8IZ40 523 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 PAF1Q8N7H5 531 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 LPCAT1Q8NF37 534 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 SPATA22Q8NHS9 363 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 KIAA1524Q8TCG1 905 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 OR1E3Q8WZA6 343 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 EID2BQ96D98 161 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 NUS1Q96E22 293 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 TEKT5Q96M29 485 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 WDR24Q96S15 920 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 LYSMD1Q96S90 227 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 AGAP2Q99490 1192 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 FAM118BQ9BPY3 351 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 SLC25A51Q9H1U9 297 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 GLOD4Q9HC38 313 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 PCDH9Q9HC56 1237 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 NLGN3Q9NZ94 848 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 SEPT10Q9P0V9 454 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 APC2O95996 2303 aa7.29□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 KNTC1P50748 2209 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 CACNA1BQ00975 2339 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 CCDC66A2RUB6 948 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 FAM149AA5PLN7 773 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 F5H423 210 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 RFPL3O75679 317 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 CLDN7O95471 211 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 CAPNS1P04632 268 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 PIRTP0C851 137 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 CKMT1AP12532 417 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 TSHRP16473 764 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 CKMT2P17540 419 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 NFKB1P19838 968 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 CES1P23141 567 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 ACP1P24666 158 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 HK3P52790 923 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 RWDD2BP57060 319 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 GSDMDP57764 484 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 SRP54P61011 504 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 RPL26P61254 145 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 CCZ1BP86790 482 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 CDK3Q00526 305 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 PPARDQ03181 441 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 PTK2BQ14289 1009 aa7.28□□□□□ -1.24
TTR-201ENST00000237014 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
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