RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000226218.8

VTN-201, Transcript of vitronectin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VTN, Length 2,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTN-201ENST00000226218 APLP1P51693 650 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 RABGGTBP53611 331 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 MAPK10P53779 464 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 GEMP55040 296 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 HERVK_113P63132 956 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 SNX17Q15036 470 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 KIAA0319Q5VV43 1072 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 KANK2Q63ZY3 851 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 SFRP1Q8N474 314 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 BPIFB1Q8TDL5 484 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 TSPEARQ8WU66 669 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 TWIST2Q8WVJ9 160 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 MRGPRX2Q96LB1 330 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 ERVK-6Q9BXR3 956 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 MROQ9BYG7 248 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 TRIM8Q9BZR9 551 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 ALG2Q9H553 416 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 SEPT3Q9UH03 358 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 OTOFQ9HC10 1997 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 PIP5K1BO14986 540 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 LDLRP01130 860 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 IDUAP35475 653 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 SLC26A3P40879 764 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 FOXA1P55317 472 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 MAP3K7CLP57077 242 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 RAB41Q5JT25 222 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 BROXQ5VW32 411 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 TOP6BLQ8N6T0 577 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 PTERQ96BW5 349 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 MUS81Q96NY9 551 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 TKTL2Q9H0I9 626 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 TUBB1Q9H4B7 451 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 ALG9Q9H6U8 611 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 CPQQ9Y646 472 aa15.44■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 KRBA1A5PL33 1030 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 UPK1AO00322 258 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 PPP6CO00743 305 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 MAFKO60675 156 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 NCAM1P13591 858 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 BDNFP23560 247 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 HRH2P25021 359 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 CDH13P55290 713 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 CD300CQ08708 224 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 AQP6Q13520 282 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 SV2CQ496J9 727 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 XKR4Q5GH76 650 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 RABL3Q5HYI8 236 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 RIMKLAQ8IXN7 391 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 ABHD11Q8NFV4 315 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 SH3RF2Q8TEC5 729 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 OSCP1Q8WVF1 389 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 ASB2Q96Q27 587 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 ALPK1Q96QP1 1244 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 ZNF347Q96SE7 839 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 CORO1BQ9BR76 489 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 C16orf70Q9BSU1 422 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 NTN4Q9HB63 628 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 TMED5Q9Y3A6 229 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 TRIM17Q9Y577 477 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 GPR45Q9Y5Y3 372 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 HUS1O60921 280 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 PRSS23O95084 383 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 HLA-DQB2P05538 268 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 ZNF286BP0CG31 522 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 NCK1P16333 377 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 AKAP5P24588 427 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 GSTM2P28161 218 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 CDKN2DP55273 166 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 LIPEQ05469 1076 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 ITGADQ13349 1161 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 CRY1Q16526 586 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 ARTNQ5T4W7 220 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 GPR158Q5T848 1215 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 ARMCX2Q7L311 632 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 ZMIZ2Q8NF64 920 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 SLC22A17Q8WUG5 538 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 SMOQ99835 787 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 WDCPQ9H6R7 721 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 CNGB3Q9NQW8 809 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 DSEQ9UL01 958 aa15.43■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 A0A1W2PP18 115 aa15.42■□□□□ 0.06
VTN-201ENST00000226218 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms