RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 PHACTR4Q8IZ21 702 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 FAM174AQ8TBP5 190 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 CCM2Q9BSQ5 444 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 EVA1AQ9H8M9 152 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 REEP1Q9H902 201 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 C15orf41Q9Y2V0 281 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 SIN3BO75182 1162 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 PIGNO95427 931 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ZNF23P17027 643 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 DRD4P21917 467 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ACOX1Q15067 660 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TMEM154Q6P9G4 183 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 IL27RAQ6UWB1 636 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 PGBD3Q8N328 593 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 PPP1R14BQ96C90 147 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 FAM84AQ96KN4 292 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 AZIN1O14977 448 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 DCXO43602 365 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 HS6ST1O60243 411 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 WNT3AP56704 352 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 GALNT2Q10471 571 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 CASP12Q6UXS9 341 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 FAM228AQ86W67 206 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 HIPK4Q8NE63 616 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 KAT5Q92993 513 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 PCDHB18PQ96TA0 734 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 STMN3Q9NZ72 180 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 CENPXA8MT69 81 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 MEI4A8MW99 385 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 NBNO60934 754 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 SPIN4Q56A73 249 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 MPP7Q5T2T1 576 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 EEF1DP3Q658K8 133 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TAPT1Q6NXT6 567 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 CNBD2Q96M20 576 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 MFSD1Q9H3U5 465 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 DEC1Q9P2X7 70 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 SEC14L4Q9UDX3 406 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ADAMDEC1O15204 470 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 SLC22A3O75751 556 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ATP6V1C1P21283 382 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 HNF4AP41235 474 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 GNPDA1P46926 289 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 CXCR3P49682 368 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 CLK3P49761 638 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
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SETX-201ENST00000224140 C14orf80Q86SX3 495 aa6.32□□□□□ -1.4
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SETX-201ENST00000224140 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 RORBQ92753 470 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 NPY6RQ99463 290 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 AIF1LQ9BQI0 150 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ZNF446Q9NWS9 450 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 PADI4Q9UM07 663 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ITM2BQ9Y287 266 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TRIP11Q15643 1979 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 STX16O14662 325 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 EDN1P05305 212 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 GNAZP19086 355 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 MYL12AP19105 171 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ATAT1Q5SQI0 421 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TMEM26Q6ZUK4 368 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 KDELC2Q7Z4H8 507 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 DHRSXQ8N5I4 330 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 MYLK2Q9H1R3 596 aa6.32□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 BRWD3Q6RI45 1802 aa6.31□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 DUXAA6NLW8 204 aa6.31□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 AREL1O15033 823 aa6.31□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 LRIG2O94898 1065 aa6.31□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 NR1H2P55055 460 aa6.31□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TAS2R40P59535 323 aa6.31□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ACTR3P61158 418 aa6.31□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 PFKPQ01813 784 aa6.31□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 RIBC2Q9H4K1 309 aa6.31□□□□□ -1.4
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