RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000205636.3

CMTM6-201, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM6, Length 3,863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6-201ENST00000205636 TMC2Q8TDI7 906 aa14.71□□□□□ -0.05
CMTM6-201ENST00000205636 FAM84AQ96KN4 292 aa14.71□□□□□ -0.05
CMTM6-201ENST00000205636 C8orf37Q96NL8 207 aa14.71□□□□□ -0.05
CMTM6-201ENST00000205636 SH2D3AQ9BRG2 576 aa14.71□□□□□ -0.05
CMTM6-201ENST00000205636 ZNF195O14628 629 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 MSH4O15457 936 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 GPIP06744 558 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 SOX6P35712 828 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 CCR10P46092 362 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 GCNT1Q02742 428 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 AP3B2Q13367 1082 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 TAB1Q15750 504 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 ADPRMQ3LIE5 342 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 ALG1LQ6GMV1 187 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 TIFABQ6ZNK6 161 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 LRRN4Q8WUT4 740 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 TMCO6Q96DC7 493 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 CPXM1Q96SM3 734 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 C2orf40Q9H1Z8 148 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 ANKRD12Q6UB98 2062 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 H0YAE9 185 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 CCNYL3P0C7X3 344 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 KCNJ11Q14654 390 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 GDPD3Q7L5L3 318 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 STRA8Q7Z7C7 330 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 GHITMQ9H3K2 345 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 MALT1Q9UDY8 824 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 HS6ST1O60243 411 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 PRPSAP2O60256 369 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 ERVK-10P10266 1014 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 CD36P16671 472 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 CRHBPP24387 322 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 ZNF45Q02386 682 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 GALEQ14376 348 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 EPHX4Q8IUS5 362 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 PIP5K1AQ99755 562 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 FEM1AQ9BSK4 669 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 ROGDIQ9GZN7 287 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa14.7□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 H3BMM5 538 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 NDUFB10O96000 172 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 RBP1P09455 135 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 TSPAN7P41732 249 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 ENPEPQ07075 957 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 QRICH1Q2TAL8 776 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 TTLL6Q8N841 843 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 ANKRD52Q8NB46 1076 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 MCUQ8NE86 351 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 TTC9Q92623 222 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 RIPOR3Q96MK2 946 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 EXD2Q9NVH0 621 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 SNX6Q9UNH7 406 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 A0A1W2PRQ8 180 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 CLRN2A0PK11 232 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 LTFP02788 710 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 CBLP22681 906 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 CHRNB3Q05901 458 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 ZNF33BQ06732 778 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 DNAAF3Q8N9W5 541 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 CDADC1Q9BWV3 514 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 APOL5Q9BWW9 433 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 MICAL3Q7RTP6 2002 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 AGAP5A6NIR3 686 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 GRIN3BO60391 1043 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 CAPNS1P04632 268 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 DDOSTP39656 456 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 RAP1GAPP47736 663 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 ZMYND11Q15326 602 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 KLHL12Q53G59 568 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 GADL1Q6ZQY3 521 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 BBS7Q8IWZ6 715 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 MPP5Q8N3R9 675 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 FAM110BQ8TC76 370 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 ANKHQ9HCJ1 492 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa14.69□□□□□ -0.06
CMTM6-201ENST00000205636 PKD1L3Q7Z443 1732 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.5 ms