RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000199420.4

Csde1-215, Transcript of Cold shock domain-containing protein E1, mouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Csde1, Length 4,185 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Sez6l2	Q4V9Z5	910 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Bod1	Q5SQY2	173 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Cyp4b1	Q64462	511 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Usp7	Q6A4J8	1103 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Ces5a	Q6AW46	575 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Ints6	Q6PCM2	883 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Kmt5c	Q6Q783	468 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Ankrd45	Q810N6	248 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Pimreg	Q8BFY7	231 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Trim23	Q8BGX0	574 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Itpk1	Q8BYN3	419 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Phtf2	Q8CB19	747 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Depdc1a	Q8CIG0	804 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Krtcap3	Q8K177	240 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Pphln1	Q8K2H1	381 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Zfp940	Q8R2Q3	566 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Cdc16	Q8R349	620 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Fbxo33	Q8VE08	562 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Oas1d	Q8VI95	361 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Cdkal1	Q91WE6	578 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Pcdha11	Q91Y19	950 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Dusp7	Q91Z46	422 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Lpin1	Q91ZP3	924 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Fam212a	Q9CX62	282 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Uqcrc1	Q9CZ13	480 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Mdm1	Q9D067	708 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Slc5a3	Q9JKZ2	718 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Mpp6	Q9JLB0	553 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Trip4	Q9QXN3	581 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Ulk2	Q9QY01	1037 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Hs6st1	Q9QYK5	411 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Nes	Q6P5H2	1864 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Gm16432	A0A0A6YXX9	775 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Prdm12	A2AJ77	365 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Olfr1305	A2AVW3	312 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Gm572	B1ARY8	399 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Eif2b3	B1AUN2	452 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Nfx1	B1AY10	1114 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Ssxb8	B1AY40	170 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Ism2	D3Z6A3	493 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Sod3	O09164	251 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Kl	O35082	1014 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Kmt5a	Q2YDW7	349 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Lhfpl5	Q4KL25	219 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Kctd1	Q5M956	257 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Foxd1	Q61345	456 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Pabpc2	Q62029	628 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Tsn	Q62348	228 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Kdsr	Q6GV12	332 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Ms4a5	Q810P8	197 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Acp6	Q8BP40	418 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Strip1	Q8C079	837 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Aoc1	Q8JZQ5	751 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Adgrg1	Q8K209	687 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Batf2	Q8R1H8	277 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Pcdhb18	Q91Y02	792 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420		Q922M7	232 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Mta3	Q924K8	591 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Col25a1	Q99MQ5	666 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Cst11	Q9D269	139 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Mrpl17	Q9D8P4	176 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Spock2	Q9ER58	423 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Hacl1	Q9QXE0	581 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Casr	Q9QY96	1079 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Clcnkb	Q9WUB6	687 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Ccdc88a	Q5SNZ0	1873 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Cdh23	Q99PF4	3354 aa		5.76	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Polr2a	P08775	1970 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Dennd4a	E9Q8V6	1869 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Dhx35	A2ACQ1	703 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Cyp4f17	G3UW78	524 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Rhox2h	K7N6P1	191 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Gm3278	L7N2D2	218 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Nek2	O35942	443 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Tulp3	O88413	460 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Cd2	P08920	344 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Tlx1	P43345	332 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Cxcl5	P50228	132 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Rab10	P61027	200 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Cdh9	P70407	786 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Lilrb3	P97484	841 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Nfe2	Q07279	373 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Ptchd3	Q0EEE2	906 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Cdon	Q32MD9	1250 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Pomk	Q3TUA9	349 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Eef2kmt	Q3UZW7	335 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Dcdc2	Q5DU00	475 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Armc5	Q5EBP3	926 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Kcna5	Q61762	602 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Postn	Q62009	838 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Pan3	Q640Q5	837 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Foxb2	Q64733	428 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Cndp1	Q8BUG2	492 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Serpina3b	Q8BYY9	420 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Trmt6	Q8CE96	497 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Tada2a	Q8CHV6	443 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Katnal1	Q8K0T4	488 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Coq9	Q8K1Z0	313 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Bphl	Q8R164	291 aa		5.75	□□□□□ -1.49
Csde1-215	ENSMUST00000199420	Hid1	Q8R1F6	788 aa		5.75	□□□□□ -1.49

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