RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AtminQ6P9S1 818 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tdpoz3Q717B4 365 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rslcan18Q7M6X5 460 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc7a4Q8BLQ7 635 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rd3Q8BRE0 195 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kank2Q8BX02 843 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dapk2Q8VDF3 370 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CenpsQ9D084 142 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Itih4A6X935 942 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pramef20B1ARV6 477 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klrb1bP27812 223 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hmx2P43687 273 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Itga11P61622 1188 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dnajb14Q149L6 379 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zc3h15Q3TIV5 426 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc22a23Q3UHH2 689 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pfdn4Q3UWL8 134 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Phf12Q5SPL2 1003 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lair1Q8BG84 263 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PrkxQ922R0 355 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ten1Q9D7K2 161 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hmgn3Q9DCB1 99 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pold3Q9EQ28 462 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plscr1Q9JJ00 328 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cngb3Q9JJZ9 694 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nt5cQ9JM14 200 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znhit2Q9QY66 399 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm28363A0A087WQW2 129 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp882E9Q4R4 555 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ceacam3E9Q6J4 706 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm5160F8VPN3 147 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hes2O54792 157 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r1O70410 912 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atxn1lP0C7T6 687 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 BdnfP21237 249 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Irs1P35569 1233 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TgfbiP82198 683 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppm1hQ3UYC0 513 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Casc4Q6P2L7 435 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tas2r106Q7M724 308 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MroQ7TNB4 248 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp606Q7TSV0 794 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sgo2Q7TSY8 1164 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sept11Q8C1B7 431 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc46a2Q8CA03 479 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rftn2Q8CHX7 500 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ugt2b34Q8K154 532 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dhrs7bQ99J47 323 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mrps18aQ99N85 196 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Retreg3Q9CQV4 466 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gid8Q9D7M1 228 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Il18rapQ9Z2B1 614 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rpl9-ps1S4R1R7 191 aa16.05■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm21964A0A1W2P7S4 437 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 L3mbtl1A2A5N8 826 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nccrp1G3X9C2 266 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AldoaP05064 364 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trpv5P69744 723 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fmo5P97872 533 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp2j13Q3UNV4 503 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm5800Q497L3 186 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Serpina3gQ5I2A0 440 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Khdrbs1Q60749 443 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Il15raQ60819 263 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ifit3Q64345 403 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RetsatQ64FW2 609 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 4933409G03RikQ8C5U0 320 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nox1Q8CIZ9 591 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc35b2Q91ZN5 431 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Actl7aQ9QY84 440 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8267E9Q207 261 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc11a2P49282 568 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Eml1Q05BC3 814 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q3KNL4 93 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf235Q61116 645 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppp1r14bQ62084 147 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pgs1Q8BHF7 553 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trmt2bQ8BQJ6 493 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mbtps2Q8CHX6 515 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Abhd11Q8K4F5 307 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc30a5Q8R4H9 761 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdhr5Q8VHF2 831 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CinpQ9D0V8 212 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Upk1aQ9D132 257 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 H2bfmQ9DAB5 224 aa16.04■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ighg3A0A1Y7VJN6 399 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Erich1E9PY43 332 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NapsaO09043 419 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcnj2P35561 428 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sipa1P46062 1037 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ZbbxQ0P5X5 716 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mrgprb1Q3UG61 350 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adora2aQ60613 410 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ces2bQ6PDB7 556 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpr141Q7TQP0 305 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smarcal1Q8BJL0 910 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Amz1Q8BVF9 502 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem252Q8C353 183 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ttc25Q9D4B2 624 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc13a2Q9ES88 586 aa16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.6 ms