RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613916.1

PVT1-222, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 137 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-222	ENST00000613916	LIMK2	P53671	638 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SLC18A1	P54219	525 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	MPP1	Q00013	466 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	KDSR	Q06136	332 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CTBP1	Q13363	440 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SEMA3A	Q14563	771 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ACCSL	Q4AC99	568 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	GRTP1	Q5TC63	336 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	MROH9	Q5TGP6	573 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	NEPRO	Q6NW34	567 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	MTSS1L	Q765P7	747 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF366	Q8N895	744 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	BANP	Q8N9N5	519 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	TERB1	Q8NA31	727 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	NELL1	Q92832	810 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ISL2	Q96A47	359 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CENPT	Q96BT3	561 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	MTBP	Q96DY7	904 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	LYSMD1	Q96S90	227 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CIPC	Q9C0C6	399 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	HACD3	Q9P035	362 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	IL17C	Q9P0M4	197 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF711	Q9Y462	761 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PVT1-222	ENST00000613916	TSPAN11	A1L157	253 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916		H7C0S8	307 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	SLC30A4	O14863	429 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	TIMM44	O43615	452 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	BNIP3L	O60238	219 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	CRTAM	O95727	393 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	S1PR4	O95977	384 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	MT-ND3	P03897	115 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	UGT2B4	P06133	528 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	CTSL	P07711	333 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	PYGB	P11216	843 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	PAM	P19021	973 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	CA4	P22748	312 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	SERPINA4	P29622	427 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	HNF1B	P35680	557 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	GMPR	P36959	345 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	SOX9	P48436	509 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	STARD6	P59095	220 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	TMPRSS15	P98073	1019 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	XIAP	P98170	497 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	DNAJC3	Q13217	504 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	LAMB3	Q13751	1172 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	GRM3	Q14832	879 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	TERF2	Q15554	542 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	PPM1J	Q5JR12	505 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	LGSN	Q5TDP6	509 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	CNST	Q6PJW8	725 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	GALNT7	Q86SF2	657 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	YAF2	Q8IY57	180 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PVT1-222	ENST00000613916	KDM1B	Q8NB78	822 aa		7.33	□□□□□ -1.24

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