RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606352.1

RNU6-90P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 90, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-90P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-90P-201ENST00000606352 HAUS8Q9BT25 410 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 CDH19Q9H159 772 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 NUP62CLQ9H1M0 184 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 SIX2Q9NPC8 291 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 NECTIN3Q9NQS3 549 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 HOMER2Q9NSB8 354 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 B4GALT7Q9UBV7 327 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 POLG2Q9UHN1 485 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 ACSL5Q9ULC5 683 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 SNX13Q9Y5W8 968 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 STK36Q9NRP7 1315 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 POM121BA6NF01 834 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 TCP11X1B4DZS4 312 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 SOCS3O14543 225 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 APOL1O14791 398 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 DNPH1O43598 174 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 SERPINC1P01008 464 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 CYP21A2P08686 494 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 CHN1P15882 459 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 NPPBP16860 134 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF32P17041 273 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 NR2C2P49116 596 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 MVDP53602 400 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 KIR2DS3Q14952 304 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 CTF1Q16619 201 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 ARL13BQ3SXY8 428 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 FBXO43Q4G163 708 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 FHL5Q5TD97 284 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 ANKRD54Q6NXT1 300 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 KLHL17Q6TDP4 642 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 SH2D5Q6ZV89 423 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 MTSS1LQ765P7 747 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 POM121L12Q8N7R1 296 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 C17orf47Q8NEP4 570 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZFAND2BQ8WV99 257 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 OTULINQ96BN8 352 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 C18orf8Q96DM3 657 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF285Q96NJ3 590 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 MPHOSPH8Q99549 860 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 KATNAL1Q9BW62 490 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 APOL5Q9BWW9 433 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLITRK2Q9H156 845 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 RAD21L1Q9H4I0 556 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 KAT14Q9H8E8 782 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 THAP1Q9NVV9 213 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 HDAC6Q9UBN7 1215 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 CORO2BQ9UQ03 480 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 TNNQ9UQP3 1299 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLC6A5Q9Y345 797 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 HCFC1P51610 2035 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 A0A087WW49 117 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 C5orf60A6NFR6 353 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 MAGEB17A8MXT2 336 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 FAM220BPB1ANY3 271 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 KLRF2D3W0D1 207 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 CLIC2O15247 247 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 KLK8O60259 260 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 ATP2C2O75185 946 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 ALDH1L1O75891 902 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 AP2A2O94973 939 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 CLPTM1O96005 669 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 RAF1P04049 648 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 FAM106CPP0CH98 169 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 MGMTP16455 207 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF23P17027 643 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 CD58P19256 250 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 MSH3P20585 1137 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 BCL3P20749 454 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 ITGA3P26006 1051 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 WNT5AP41221 380 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 CASP5P51878 434 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 LYZP61626 148 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 PAX8Q06710 450 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 NFATC2Q13469 925 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 IL13RA2Q14627 380 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 ARHGEF6Q15052 776 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 NECTIN1Q15223 517 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 RAB30Q15771 203 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR7E24Q6IFN5 339 aa0.47□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms