RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596778.1

AC003973.2-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AC003973.2, Length 1,394 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC003973.2-201ENST00000596778 TPSAB1Q15661 275 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 CSRP2Q16527 193 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 DUOXA1Q1HG43 343 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 PDPK2PQ6A1A2 396 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 TTC27Q6P3X3 843 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 SYT10Q6XYQ8 523 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 TMC3Q7Z5M5 1100 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 TMEFF1Q8IYR6 380 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 FRMD1Q8N878 549 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 CCDC89Q8N998 374 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 MFSD2AQ8NA29 543 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 SPATA22Q8NHS9 363 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 CCDC110Q8TBZ0 833 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 CXorf40AQ8TE69 158 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 SKA1Q96BD8 255 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 MS4A14Q96JA4 679 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 TBATAQ96M53 351 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 COQ10AQ96MF6 247 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 FSD1LQ9BXM9 530 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 CDC23Q9UJX2 597 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 GMEB2Q9UKD1 530 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 CHKBQ9Y259 395 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 DMDP11532 3685 aa6.66□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.65□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 CEP192Q8TEP8 1941 aa6.65□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 ZNF292O60281 2723 aa6.65□□□□□ -1.34
AC003973.2-201ENST00000596778 A0A1W2PR77 199 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 MEI4A8MW99 385 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 H7C0S8 307 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 NEMP1O14524 444 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 YKT6O15498 198 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 METTL18O95568 372 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 ECEL1O95672 775 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 ELFN1P0C7U0 828 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 ZNF883P0CG24 379 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 MLNP12872 115 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 C6P13671 934 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 GM2AP17900 193 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 TGM1P22735 817 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 LHCGRP22888 699 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 PSMB4P28070 264 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 AKT2P31751 481 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 RPL22P35268 128 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 HNF1BP35680 557 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 MPLP40238 635 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 RABIFP47224 123 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 LIMK1P53667 647 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 EPHB1P54762 984 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 PFN3P60673 137 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 PPP2CBP62714 309 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 PPP2CAP67775 309 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 PTSQ03393 145 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 SGCGQ13326 291 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 MTM1Q13496 603 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 PTK6Q13882 451 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 ARHGEF7Q14155 803 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 TEAD4Q15561 434 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 CNGA3Q16281 694 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 SIRPB2Q5JXA9 342 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 IL27RAQ6UWB1 636 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 PCGF5Q86SE9 256 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 FAM124AQ86V42 546 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 HOOK3Q86VS8 718 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 CACUL1Q86Y37 369 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 OXR1Q8N573 874 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 MCUQ8NE86 351 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 SPATA4Q8NEY3 305 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 KIF18AQ8NI77 898 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 BRSK1Q8TDC3 778 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 DTD2Q96FN9 168 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 SGSM3Q96HU1 749 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 RANBP9Q96S59 729 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 FAM118BQ9BPY3 351 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 CEP41Q9BYV8 373 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 C12orf49Q9H741 205 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 EBF2Q9HAK2 575 aa6.65□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms