RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593152.6

ATP5A1-220, Transcript of ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATP5A1, Length 2,258 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1-220ENST00000593152 GLP2RO95838 553 aa22.96■■□□□ 1.27
ATP5A1-220ENST00000593152 GOT2P00505 430 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ATP5A1-220ENST00000593152 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
ATP5A1-220ENST00000593152 FGFR3P22607 806 aa22.96■■□□□ 1.27
ATP5A1-220ENST00000593152 SDHAF4Q5VUM1 108 aa22.96■■□□□ 1.27
ATP5A1-220ENST00000593152 PPP4R4Q6NUP7 873 aa22.96■■□□□ 1.27
ATP5A1-220ENST00000593152 CANT1Q8WVQ1 401 aa22.96■■□□□ 1.27
ATP5A1-220ENST00000593152 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ATP5A1-220ENST00000593152 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ATP5A1-220ENST00000593152 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
ATP5A1-220ENST00000593152 H6PDO95479 791 aa22.96■■□□□ 1.27
ATP5A1-220ENST00000593152 SLC4A1P02730 911 aa22.96■■□□□ 1.27
ATP5A1-220ENST00000593152 THPOP40225 353 aa22.96■■□□□ 1.27
ATP5A1-220ENST00000593152 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
ATP5A1-220ENST00000593152 OR4D1Q15615 310 aa22.96■■□□□ 1.27
ATP5A1-220ENST00000593152 FBXL22Q6P050 247 aa22.96■■□□□ 1.27
ATP5A1-220ENST00000593152 LRCH3Q96II8 777 aa22.96■■□□□ 1.27
ATP5A1-220ENST00000593152 ATOH8Q96SQ7 321 aa22.96■■□□□ 1.27
ATP5A1-220ENST00000593152 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ATP5A1-220ENST00000593152 FBXO44Q9H4M3 255 aa22.96■■□□□ 1.27
ATP5A1-220ENST00000593152 OLAHQ9NV23 265 aa22.96■■□□□ 1.27
ATP5A1-220ENST00000593152 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ATP5A1-220ENST00000593152 NME4O00746 187 aa22.95■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 ATP6V1B2P21281 511 aa22.95■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 PBX3P40426 434 aa22.95■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 SEMA3AQ14563 771 aa22.95■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 DDR2Q16832 855 aa22.95■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 PITRM1Q5JRX3 1037 aa22.95■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 KANK2Q63ZY3 851 aa22.95■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 C17orf99Q6UX52 265 aa22.95■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 ERMP1Q7Z2K6 904 aa22.95■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 MINDY1Q8N5J2 469 aa22.95■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa22.95■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 TSPAN14Q8NG11 270 aa22.95■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 TWIST2Q8WVJ9 160 aa22.95■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 BTN2A3PQ96KV6 586 aa22.95■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 C8orf48Q96LL4 319 aa22.95■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 MID1IP1Q9NPA3 183 aa22.95■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.265e-8■■□□□ 12.7
ATP5A1-220ENST00000593152 PLXNA3P51805 1871 aa22.95■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 CCDC160A6NGH7 325 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 DRGXA6NNA5 263 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 ZNF839A8K0R7 811 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 AZIN1O14977 448 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 INPPL1O15357 1258 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 ZNF23P17027 643 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 GRIA3P42263 894 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 GPR15P49685 360 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 FOXA1P55317 472 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 SERINC3Q13530 473 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 LAMB3Q13751 1172 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 LPIN1Q14693 890 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 KIF19Q2TAC6 998 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 TMEM259Q4ZIN3 620 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 NHSL2Q5HYW2 709 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 MRNIPQ6NTE8 343 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 MYO1HQ8N1T3 1032 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 FEM1CQ96JP0 617 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 TMEM79Q9BSE2 394 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 HAUS8Q9BT25 410 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 ANKRD60Q9BZ19 345 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 OCEL1Q9H607 264 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 ARL5AQ9Y689 179 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 CEPT1Q9Y6K0 416 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 CCDC162PA2VCL2 907 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 UBXN8O00124 270 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 PIP5K1BO14986 540 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 TIPRLO75663 272 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 OAZ2O95190 189 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 MATN4O95460 622 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 STAMBPO95630 424 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 EPOP01588 193 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 HLA-DPA1P20036 260 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 PRKCQQ04759 706 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 BIRC2Q13490 618 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 PTPRCAPQ14761 206 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 CYTH1Q15438 398 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 MAP7D1Q3KQU3 841 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 PRMT9Q6P2P2 845 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 ZNF354CQ86Y25 554 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 EXT2Q93063 718 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 CYP2S1Q96SQ9 504 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 SEMA3CQ99985 751 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 TUBB1Q9H4B7 451 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 GMIPQ9P107 970 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 RIMKLBQ9ULI2 386 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa22.94■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 LRRC14BA6NHZ5 514 aa22.93■■□□□ 1.26
ATP5A1-220ENST00000593152 AQP12BA6NM10 295 aa22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms