RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CAPNS1-209ENST00000590049 PCDH19Q8TAB3 1148 aa11.65□□□□□ -0.54
CAPNS1-209ENST00000590049 USP7Q93009 1102 aa11.65□□□□□ -0.54
CAPNS1-209ENST00000590049 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CAPNS1-209ENST00000590049 CARD6Q9BX69 1037 aa11.65□□□□□ -0.54
CAPNS1-209ENST00000590049 AP1M1Q9BXS5 423 aa11.65□□□□□ -0.54
CAPNS1-209ENST00000590049 MAGEB5Q9BZ81 275 aa11.65□□□□□ -0.54
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CAPNS1-209ENST00000590049 L2HGDHQ9H9P8 463 aa11.65□□□□□ -0.54
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CAPNS1-209ENST00000590049 SCML1Q9UN30 329 aa11.65□□□□□ -0.54
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CAPNS1-209ENST00000590049 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa11.64□□□□□ -0.55
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CAPNS1-209ENST00000590049 DRGXA6NNA5 263 aa11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 C10orf142B7Z368 130 aa11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 H7C0C1 242 aa11.64□□□□□ -0.55
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CAPNS1-209ENST00000590049 NKX2-8O15522 239 aa11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 TBL1XO60907 577 aa11.64□□□□□ -0.55
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CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
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CAPNS1-209ENST00000590049 MX2P20592 715 aa11.64□□□□□ -0.55
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CAPNS1-209ENST00000590049 OR1E1P30953 314 aa11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 ATP5OP48047 213 aa11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 MAPKAPK2P49137 400 aa11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 CDH18Q13634 790 aa11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 STAT4Q14765 748 aa11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 PERM1Q5SV97 790 aa11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 MANEALQ5VSG8 457 aa11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 CHST9Q7L1S5 443 aa11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 PQLC3Q8N755 202 aa11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 SPATA4Q8NEY3 305 aa11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 GRK7Q8WTQ7 553 aa11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 SORCS1Q8WY21 1168 aa11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 NKD1Q969G9 470 aa11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 WBP2Q969T9 261 aa11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 CCDC114Q96M63 670 aa11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM248Q9NWD8 314 aa11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 RP1P56715 2156 aa11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 ACANP16112 2415 aa11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
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CAPNS1-209ENST00000590049 WASH4PA8MWX3 477 aa11.63□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 C9orf172C9J069 976 aa11.63□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 CASC3O15234 703 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 TIMM44O43615 452 aa11.63□□□□□ -0.55
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CAPNS1-209ENST00000590049 RHOCP08134 193 aa11.63□□□□□ -0.55
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CAPNS1-209ENST00000590049 ITGB7P26010 798 aa11.63□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 CHRNA3P32297 505 aa11.63□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 ETFBP38117 255 aa11.63□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 TUBB4BP68371 445 aa11.63□□□□□ -0.55
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CAPNS1-209ENST00000590049 C2orf54Q08AI8 447 aa11.63□□□□□ -0.55
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CAPNS1-209ENST00000590049 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
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CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM164Q5U3C3 297 aa11.63□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 GSTA5Q7RTV2 222 aa11.63□□□□□ -0.55
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CAPNS1-209ENST00000590049 MFN1Q8IWA4 741 aa11.63□□□□□ -0.55
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CAPNS1-209ENST00000590049 FAM217AQ8IXS0 508 aa11.63□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 CFAP52Q8N1V2 620 aa11.63□□□□□ -0.55
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CAPNS1-209ENST00000590049 PLD5Q8N7P1 536 aa11.63□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 ACTL9Q8TC94 416 aa11.63□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 C1orf54Q8WWF1 131 aa11.63□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 NAT6Q93015 286 aa11.63□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC45A3Q96JT2 553 aa11.63□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 FOXP3Q9BZS1 431 aa11.63□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 SERGEFQ9UGK8 458 aa11.63□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 CROCCQ5TZA2 2017 aa11.62□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 SCN8AQ9UQD0 1980 aa11.62□□□□□ -0.55
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