RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576390.5

P4HB-223, Transcript of prolyl 4-hydroxylase subunit beta, human

TSL 4 BASIC

Gene P4HB, Length 439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
P4HB-223	ENST00000576390	MAX	P61244	160 aa		18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	CDK3	Q00526	305 aa		18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	ARHGEF7	Q14155	803 aa		18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	TGIF1	Q15583	401 aa		18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	JAML	Q86YT9	394 aa		18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	MED8	Q96G25	268 aa		18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		18.91	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	FZD6	O60353	706 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	SERPINC1	P01008	464 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	NFKBIA	P25963	317 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	CDH6	P55285	790 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	DPT	Q07507	201 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	NR1I3	Q14994	352 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	PTPRR	Q15256	657 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390		Q6ZVL8	140 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	BBS5	Q8N3I7	341 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	TEX26	Q8N6G2	289 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	FAM71B	Q8TC56	605 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	HSPH1	Q92598	858 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	SUFU	Q9UMX1	484 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		18.9	■□□□□ 0.62
P4HB-223	ENST00000576390	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390		B8ZZF3	427 aa		18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390		J3QKU1	62 aa		18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	PRAMEF10	O60809	474 aa		18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	CPNE6	O95741	557 aa		18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	SOD1	P00441	154 aa		18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	IVL	P07476	585 aa		18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	IL4R	P24394	825 aa		18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	SERPINB6	P35237	376 aa		18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	MMP13	P45452	471 aa		18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	18.89	■□□□□ 0.61	3e-8	■■■□□ 18
P4HB-223	ENST00000576390	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	MARC1	Q5VT66	337 aa		18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	DENND2C	Q68D51	928 aa		18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	DTX1	Q86Y01	620 aa		18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	CMKLR1	Q99788	373 aa		18.89	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	C9orf172	C9J069	976 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	GNPDA1	P46926	289 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	LINC00303	Q3SY05	128 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	PIM3	Q86V86	326 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	NAGS	Q8N159	534 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	USP7	Q93009	1102 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	THAP2	Q9H0W7	228 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	ECEL1	O95672	775 aa		18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	PDHA1	P08559	390 aa		18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	ADCY8	P40145	1251 aa		18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	PBX1	P40424	430 aa		18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	POLD2	P49005	469 aa		18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	ARSE	P51690	589 aa		18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	OR1D5	P58170	312 aa		18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	FANCC	Q00597	558 aa		18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	CTBS	Q01459	385 aa		18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	IHH	Q14623	411 aa		18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	MAP9	Q49MG5	647 aa		18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	USP45	Q70EL2	814 aa		18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	NLRP8	Q86W28	1048 aa		18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	SGF29	Q96ES7	293 aa		18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	BTBD6	Q96KE9	485 aa		18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	RDH14	Q9HBH5	336 aa		18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390	TENM4	Q6N022	2769 aa		18.86	■□□□□ 0.61
P4HB-223	ENST00000576390		A0A0U1RQS6	177 aa		18.86	■□□□□ 0.61

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