RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 TSHRP16473 764 aa20.89■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 FOXC1Q12948 553 aa20.89■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 FAXCQ5TGI0 409 aa20.89■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 KCTD16Q68DU8 428 aa20.89■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa20.89■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 RAET1GQ6H3X3 334 aa20.89■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa20.89■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 OR4C6Q8NH72 309 aa20.89■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 BTN2A2Q8WVV5 523 aa20.89■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 SCAMP4Q969E2 229 aa20.89■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 LRRC61Q9BV99 259 aa20.89■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 LGR4Q9BXB1 951 aa20.89■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 SLC13A1Q9BZW2 595 aa20.89■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 ABCG8Q9H221 673 aa20.89■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 CARD9Q9H257 536 aa20.89■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 KLQ9UEF7 1012 aa20.89■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM202A6NGA9 273 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 SCAMP1O15126 338 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 AQP9O43315 295 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 SIGLEC6O43699 453 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 GIMD1P0DJR0 217 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 SRP54P61011 504 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 DPTQ07507 201 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 MPP3Q13368 585 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 PRRT3Q5FWE3 981 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 CCDC70Q6NSX1 233 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF765Q7L2R6 523 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 SLCO6A1Q86UG4 719 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 HEATR4Q86WZ0 1026 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 HID1Q8IV36 788 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 PNPLA1Q8N8W4 532 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 IPMKQ8NFU5 416 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 ATL2Q8NHH9 583 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 CCDC110Q8TBZ0 833 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 LMX1AQ8TE12 382 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 AP2M1Q96CW1 435 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 PDXPQ96GD0 296 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 PDLIM2Q96JY6 352 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 MRGPRX2Q96LB1 330 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 SPATA13Q96N96 652 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 GORASP1Q9BQQ3 440 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 TEX101Q9BY14 249 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 MAGEE1Q9HCI5 957 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 SPASTQ9UBP0 616 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 SHOC2Q9UQ13 582 aa20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa20.87■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 NEMP2A6NFY4 417 aa20.87■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 ENC1O14682 589 aa20.87■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 RASGRP1O95267 797 aa20.87■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 SOD1P00441 154 aa20.87■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 KELP23276 732 aa20.87■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 PSMB4P28070 264 aa20.87■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 TEAD1P28347 426 aa20.87■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 CHRNA4P43681 627 aa20.87■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 BLKP51451 505 aa20.87■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 HK3P52790 923 aa20.87■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 RD3Q7Z3Z2 195 aa20.87■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 NRSN1Q8IZ57 195 aa20.87■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 OR56A4Q8NGH8 313 aa20.87■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 CCHCR1Q8TD31 782 aa20.87■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 ATG4AQ8WYN0 398 aa20.87■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 OR1E3Q8WZA6 343 aa20.87■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 EID2BQ96D98 161 aa20.87■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 TBATAQ96M53 351 aa20.87■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 TLR10Q9BXR5 811 aa20.87■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 FGF22Q9HCT0 170 aa20.87■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 NLGN3Q9NZ94 848 aa20.87■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF711Q9Y462 761 aa20.87■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa20.87■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 GCATO75600 419 aa20.86■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 EPOP01588 193 aa20.86■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 SLC4A1P02730 911 aa20.86■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 ALPPL2P10696 532 aa20.86■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 GPR1P46091 355 aa20.86■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 SPINT3P49223 89 aa20.86■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 CDK3Q00526 305 aa20.86■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 DNAJC3Q13217 504 aa20.86■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 C1orf61Q13536 156 aa20.86■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 PROX2Q3B8N5 592 aa20.86■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 HS1BP3Q53T59 392 aa20.86■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 SIRPB2Q5JXA9 342 aa20.86■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 SLC25A41Q8N5S1 370 aa20.86■□□□□ 0.93
TMOD3-203ENST00000558455 FAM71DQ8N9W8 422 aa20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms