RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 KRT84Q9NSB2 600 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ADPRHL2Q9NX46 363 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 PLAAQ9Y263 795 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 A0A0G2JND7 137 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 C9IYK1 514 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 TRIM49D1C9J1S8 452 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 SLC7A4O43246 635 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ADRB2P07550 413 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ALAS2P22557 587 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 TNFSF9P41273 254 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 RASA2Q15283 850 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 RNF43Q68DV7 783 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ANKRD54Q6NXT1 300 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 USP49Q70CQ1 688 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 GDPD5Q8WTR4 605 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 SELENOMQ8WWX9 145 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 PNPLA2Q96AD5 504 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 HMCESQ96FZ2 354 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 TRMOQ9BU70 441 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 KCNK4Q9NYG8 393 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 DYTNA2CJ06 578 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM150BA6NC51 233 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 SEMA4FO95754 770 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 MAPK7Q13164 816 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 RDH11Q8TC12 318 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 DEPDC7Q96QD5 511 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ZFP69BQ9UJL9 534 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ANGPT4Q9Y264 503 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 WASHC1A8K0Z3 465 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 WASH3PC4AMC7 463 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 TEX28O15482 410 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 AGR2O95994 175 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 INHBCP55103 352 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 LGALS3BPQ08380 585 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 PTPRNQ16849 979 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 MINDY4Q4G0A6 757 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 CNSTQ6PJW8 725 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 WASH2PQ6VEQ5 465 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 DPP10Q8N608 796 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM156Q8N614 296 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 SPATA4Q8NEY3 305 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 BRINP2Q9C0B6 783 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 NECTIN3Q9NQS3 549 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 PCDH10Q9P2E7 1040 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 CASKO14936 926 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ESR1P03372 595 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 S100A3P33764 101 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ARHGAP8P85298 464 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 BMPR2Q13873 1038 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 CST9Q5W186 159 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 OR5B17Q8NGF7 314 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 KLHL29Q96CT2 875 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 SMOC2Q9H3U7 446 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 CYP8B1Q9UNU6 501 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 B4DGG1 531 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 MATN3O15232 486 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 SERPINB7O75635 380 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 USP1O94782 785 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 VAPBO95292 243 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 RARAP10276 462 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 FMO4P31512 558 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 MC4RP32245 332 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 NOMO3P69849 1222 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 NR0B2Q15466 257 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 FAM153CQ494X1 144 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 HECTD2Q5U5R9 776 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ARMCX6Q7L4S7 300 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 FAM129CQ86XR2 697 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 DEPDC4Q8N2C3 294 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 MYRIPQ8NFW9 859 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ACTRT1Q8TDG2 376 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 ACMSDQ8TDX5 336 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 SMPDL3AQ92484 453 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 PPP1R14AQ96A00 147 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 OTULINQ96BN8 352 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 GYG2O15488 501 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 FCGR1AP12314 374 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 PTGER3P43115 390 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 AMZ1Q400G9 498 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 KCNT1Q5JUK3 1230 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 FAM26DQ5JW98 314 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRB-209ENST00000550857 LY6G5CQ5SRR4 150 aa8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms