RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 CKAP2Q8WWK9 683 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 PPCDCQ96CD2 204 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 FEM1CQ96JP0 617 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ROGDIQ9GZN7 287 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 LRCH1Q9Y2L9 728 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 UBXN7O94888 489 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 MFN2O95140 757 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ACADLP28330 430 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 FLT3P36888 993 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 TNFSF9P41273 254 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 PRR5P85299 388 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 RALGDSQ12967 914 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ARMC4Q5T2S8 1044 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM175Q9BSA9 504 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 SNX7Q9UNH6 387 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 PKD1L3Q7Z443 1732 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM191CA6NGB0 347 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 TAF4O00268 1085 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 CLOCKO15516 846 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 SLC28A2O43868 658 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 GJB1P08034 283 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 MMP8P22894 467 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ABRQ12979 859 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 DGKKQ5KSL6 1271 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ERICH5Q6P6B1 374 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 AP2M1Q96CW1 435 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 TCF25Q9BQ70 676 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 GINS4Q9BRT9 223 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 HMGXB4Q9UGU5 601 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 TREHO43280 583 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 IPO13O94829 963 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 PSMB9P28065 219 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 TAF10Q12962 218 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 RAB30Q15771 203 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ARMC3Q5W041 872 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 TTC23Q5W5X9 447 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 CNSTQ6PJW8 725 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 CHST9Q7L1S5 443 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 HDDC2Q7Z4H3 204 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 SMYD1Q8NB12 490 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF671Q8TAW3 534 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 SEMA4DQ92854 862 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 C12orf42Q96LP6 360 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 SGK2Q9HBY8 427 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC88CQ9P219 2028 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 YDJCA8MPS7 323 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ITGA2BP08514 1039 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 IDSP22304 550 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 MYL9P24844 172 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 FPGSQ05932 587 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 OASLQ15646 514 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 WDR60Q8WVS4 1066 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 FNDC11Q9BVV2 318 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 RHBGQ9H310 441 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 C11orf49Q9H6J7 331 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 GLOD4Q9HC38 313 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 DOCK2Q92608 1830 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 CRHR1P34998 444 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 SLC5A3P53794 718 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 PRKAG1P54619 331 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 OLR1P78380 273 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 GALNT3Q14435 633 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 PDK4Q16654 411 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 FAM151BQ6UXP7 276 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 C7orf57Q8NEG2 295 aa6.39□□□□□ -1.39
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